Protein–RNA interactions for Protein: Q96LM1

LINC00615, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00615, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00615Q96LM1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC00615Q96LM1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00615Q96LM1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00615Q96LM1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00615Q96LM1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00615Q96LM1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00615Q96LM1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC00615Q96LM1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC00615Q96LM1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC00615Q96LM1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC00615Q96LM1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC00615Q96LM1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC00615Q96LM1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC00615Q96LM1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC00615Q96LM1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LINC00615Q96LM1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC00615Q96LM1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC00615Q96LM1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC00615Q96LM1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC00615Q96LM1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC00615Q96LM1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC00615Q96LM1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC00615Q96LM1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC00615Q96LM1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC00615Q96LM1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC00615Q96LM1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC00615Q96LM1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC00615Q96LM1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC00615Q96LM1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC00615Q96LM1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC00615Q96LM1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC00615Q96LM1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC00615Q96LM1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC00615Q96LM1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC00615Q96LM1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC00615Q96LM1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC00615Q96LM1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC00615Q96LM1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC00615Q96LM1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC00615Q96LM1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC00615Q96LM1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC00615Q96LM1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC00615Q96LM1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LINC00615Q96LM1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LINC00615Q96LM1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LINC00615Q96LM1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LINC00615Q96LM1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LINC00615Q96LM1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LINC00615Q96LM1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LINC00615Q96LM1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LINC00615Q96LM1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LINC00615Q96LM1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LINC00615Q96LM1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LINC00615Q96LM1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LINC00615Q96LM1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LINC00615Q96LM1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LINC00615Q96LM1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LINC00615Q96LM1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LINC00615Q96LM1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LINC00615Q96LM1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LINC00615Q96LM1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LINC00615Q96LM1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LINC00615Q96LM1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LINC00615Q96LM1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC00615Q96LM1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC00615Q96LM1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC00615Q96LM1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC00615Q96LM1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC00615Q96LM1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC00615Q96LM1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC00615Q96LM1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC00615Q96LM1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC00615Q96LM1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00615Q96LM1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00615Q96LM1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00615Q96LM1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00615Q96LM1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00615Q96LM1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00615Q96LM1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00615Q96LM1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC00615Q96LM1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC00615Q96LM1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC00615Q96LM1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC00615Q96LM1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC00615Q96LM1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC00615Q96LM1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC00615Q96LM1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC00615Q96LM1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC00615Q96LM1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC00615Q96LM1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC00615Q96LM1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC00615Q96LM1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LINC00615Q96LM1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LINC00615Q96LM1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LINC00615Q96LM1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LINC00615Q96LM1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LINC00615Q96LM1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LINC00615Q96LM1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC00615Q96LM1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC00615Q96LM1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 230.4 ms