Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB9

PGLYRP3, Peptidoglycan recognition protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP3Q96LB9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGLYRP3Q96LB9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGLYRP3Q96LB9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGLYRP3Q96LB9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGLYRP3Q96LB9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGLYRP3Q96LB9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGLYRP3Q96LB9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGLYRP3Q96LB9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGLYRP3Q96LB9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGLYRP3Q96LB9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGLYRP3Q96LB9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGLYRP3Q96LB9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGLYRP3Q96LB9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGLYRP3Q96LB9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PGLYRP3Q96LB9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGLYRP3Q96LB9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGLYRP3Q96LB9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGLYRP3Q96LB9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
PGLYRP3Q96LB9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGLYRP3Q96LB9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGLYRP3Q96LB9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGLYRP3Q96LB9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGLYRP3Q96LB9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGLYRP3Q96LB9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGLYRP3Q96LB9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGLYRP3Q96LB9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGLYRP3Q96LB9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGLYRP3Q96LB9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGLYRP3Q96LB9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGLYRP3Q96LB9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGLYRP3Q96LB9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGLYRP3Q96LB9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGLYRP3Q96LB9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGLYRP3Q96LB9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGLYRP3Q96LB9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGLYRP3Q96LB9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGLYRP3Q96LB9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGLYRP3Q96LB9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGLYRP3Q96LB9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGLYRP3Q96LB9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGLYRP3Q96LB9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGLYRP3Q96LB9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGLYRP3Q96LB9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGLYRP3Q96LB9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGLYRP3Q96LB9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PGLYRP3Q96LB9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGLYRP3Q96LB9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PGLYRP3Q96LB9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGLYRP3Q96LB9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGLYRP3Q96LB9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGLYRP3Q96LB9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGLYRP3Q96LB9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGLYRP3Q96LB9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGLYRP3Q96LB9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGLYRP3Q96LB9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGLYRP3Q96LB9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGLYRP3Q96LB9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGLYRP3Q96LB9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGLYRP3Q96LB9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGLYRP3Q96LB9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGLYRP3Q96LB9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGLYRP3Q96LB9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGLYRP3Q96LB9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGLYRP3Q96LB9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGLYRP3Q96LB9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGLYRP3Q96LB9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGLYRP3Q96LB9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGLYRP3Q96LB9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PGLYRP3Q96LB9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGLYRP3Q96LB9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGLYRP3Q96LB9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGLYRP3Q96LB9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PGLYRP3Q96LB9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGLYRP3Q96LB9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGLYRP3Q96LB9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGLYRP3Q96LB9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGLYRP3Q96LB9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGLYRP3Q96LB9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGLYRP3Q96LB9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGLYRP3Q96LB9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGLYRP3Q96LB9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGLYRP3Q96LB9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGLYRP3Q96LB9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGLYRP3Q96LB9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGLYRP3Q96LB9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGLYRP3Q96LB9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGLYRP3Q96LB9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGLYRP3Q96LB9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGLYRP3Q96LB9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGLYRP3Q96LB9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGLYRP3Q96LB9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PGLYRP3Q96LB9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGLYRP3Q96LB9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGLYRP3Q96LB9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PGLYRP3Q96LB9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PGLYRP3Q96LB9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGLYRP3Q96LB9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGLYRP3Q96LB9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGLYRP3Q96LB9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGLYRP3Q96LB9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms