Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHAMP1Q96JM3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHAMP1Q96JM3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHAMP1Q96JM3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHAMP1Q96JM3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHAMP1Q96JM3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CHAMP1Q96JM3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CHAMP1Q96JM3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CHAMP1Q96JM3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CHAMP1Q96JM3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHAMP1Q96JM3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHAMP1Q96JM3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHAMP1Q96JM3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHAMP1Q96JM3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHAMP1Q96JM3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHAMP1Q96JM3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CHAMP1Q96JM3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CHAMP1Q96JM3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CHAMP1Q96JM3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
CHAMP1Q96JM3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHAMP1Q96JM3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CHAMP1Q96JM3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CHAMP1Q96JM3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CHAMP1Q96JM3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CHAMP1Q96JM3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CHAMP1Q96JM3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CHAMP1Q96JM3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CHAMP1Q96JM3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHAMP1Q96JM3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHAMP1Q96JM3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CHAMP1Q96JM3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CHAMP1Q96JM3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CHAMP1Q96JM3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CHAMP1Q96JM3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CHAMP1Q96JM3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHAMP1Q96JM3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHAMP1Q96JM3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHAMP1Q96JM3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHAMP1Q96JM3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHAMP1Q96JM3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CHAMP1Q96JM3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHAMP1Q96JM3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHAMP1Q96JM3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHAMP1Q96JM3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHAMP1Q96JM3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHAMP1Q96JM3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHAMP1Q96JM3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CHAMP1Q96JM3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHAMP1Q96JM3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHAMP1Q96JM3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHAMP1Q96JM3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CHAMP1Q96JM3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHAMP1Q96JM3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CHAMP1Q96JM3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHAMP1Q96JM3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHAMP1Q96JM3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHAMP1Q96JM3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHAMP1Q96JM3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHAMP1Q96JM3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHAMP1Q96JM3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHAMP1Q96JM3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHAMP1Q96JM3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHAMP1Q96JM3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CHAMP1Q96JM3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHAMP1Q96JM3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHAMP1Q96JM3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHAMP1Q96JM3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHAMP1Q96JM3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHAMP1Q96JM3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHAMP1Q96JM3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHAMP1Q96JM3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHAMP1Q96JM3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHAMP1Q96JM3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHAMP1Q96JM3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHAMP1Q96JM3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHAMP1Q96JM3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHAMP1Q96JM3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHAMP1Q96JM3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CHAMP1Q96JM3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CHAMP1Q96JM3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CHAMP1Q96JM3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHAMP1Q96JM3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHAMP1Q96JM3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHAMP1Q96JM3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHAMP1Q96JM3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHAMP1Q96JM3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHAMP1Q96JM3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHAMP1Q96JM3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHAMP1Q96JM3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHAMP1Q96JM3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHAMP1Q96JM3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHAMP1Q96JM3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHAMP1Q96JM3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHAMP1Q96JM3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHAMP1Q96JM3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHAMP1Q96JM3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHAMP1Q96JM3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHAMP1Q96JM3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHAMP1Q96JM3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHAMP1Q96JM3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms