Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
ABCC12Q96J65 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ABCC12Q96J65 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
ABCC12Q96J65 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
ABCC12Q96J65 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
ABCC12Q96J65 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
ABCC12Q96J65 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ABCC12Q96J65 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ABCC12Q96J65 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ABCC12Q96J65 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ABCC12Q96J65 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ABCC12Q96J65 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ABCC12Q96J65 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ABCC12Q96J65 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ABCC12Q96J65 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ABCC12Q96J65 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ABCC12Q96J65 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ABCC12Q96J65 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ABCC12Q96J65 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ABCC12Q96J65 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ABCC12Q96J65 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ABCC12Q96J65 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ABCC12Q96J65 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ABCC12Q96J65 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ABCC12Q96J65 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ABCC12Q96J65 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ABCC12Q96J65 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ABCC12Q96J65 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ABCC12Q96J65 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ABCC12Q96J65 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ABCC12Q96J65 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ABCC12Q96J65 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ABCC12Q96J65 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
ABCC12Q96J65 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
ABCC12Q96J65 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
ABCC12Q96J65 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
ABCC12Q96J65 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ABCC12Q96J65 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ABCC12Q96J65 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ABCC12Q96J65 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ABCC12Q96J65 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
ABCC12Q96J65 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
ABCC12Q96J65 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ABCC12Q96J65 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
ABCC12Q96J65 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ABCC12Q96J65 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ABCC12Q96J65 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ABCC12Q96J65 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ABCC12Q96J65 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ABCC12Q96J65 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ABCC12Q96J65 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ABCC12Q96J65 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
ABCC12Q96J65 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
ABCC12Q96J65 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ABCC12Q96J65 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ABCC12Q96J65 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ABCC12Q96J65 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ABCC12Q96J65 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ABCC12Q96J65 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
ABCC12Q96J65 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ABCC12Q96J65 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ABCC12Q96J65 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ABCC12Q96J65 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ABCC12Q96J65 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ABCC12Q96J65 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ABCC12Q96J65 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ABCC12Q96J65 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
ABCC12Q96J65 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ABCC12Q96J65 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ABCC12Q96J65 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ABCC12Q96J65 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
ABCC12Q96J65 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ABCC12Q96J65 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ABCC12Q96J65 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ABCC12Q96J65 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ABCC12Q96J65 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ABCC12Q96J65 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ABCC12Q96J65 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ABCC12Q96J65 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ABCC12Q96J65 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ABCC12Q96J65 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ABCC12Q96J65 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ABCC12Q96J65 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ABCC12Q96J65 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
ABCC12Q96J65 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
ABCC12Q96J65 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ABCC12Q96J65 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ABCC12Q96J65 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ABCC12Q96J65 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ABCC12Q96J65 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ABCC12Q96J65 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ABCC12Q96J65 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ABCC12Q96J65 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ABCC12Q96J65 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ABCC12Q96J65 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ABCC12Q96J65 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ABCC12Q96J65 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ABCC12Q96J65 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ABCC12Q96J65 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ABCC12Q96J65 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms