Protein–RNA interactions for Protein: Q96IP4

FAM46A, Putative nucleotidyltransferase FAM46A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46AQ96IP4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM46AQ96IP4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM46AQ96IP4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM46AQ96IP4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM46AQ96IP4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM46AQ96IP4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM46AQ96IP4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM46AQ96IP4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM46AQ96IP4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM46AQ96IP4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM46AQ96IP4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM46AQ96IP4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM46AQ96IP4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM46AQ96IP4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM46AQ96IP4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM46AQ96IP4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM46AQ96IP4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM46AQ96IP4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM46AQ96IP4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM46AQ96IP4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM46AQ96IP4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM46AQ96IP4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM46AQ96IP4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM46AQ96IP4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM46AQ96IP4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM46AQ96IP4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM46AQ96IP4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM46AQ96IP4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM46AQ96IP4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM46AQ96IP4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM46AQ96IP4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM46AQ96IP4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM46AQ96IP4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM46AQ96IP4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM46AQ96IP4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM46AQ96IP4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM46AQ96IP4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM46AQ96IP4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM46AQ96IP4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM46AQ96IP4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM46AQ96IP4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM46AQ96IP4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM46AQ96IP4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM46AQ96IP4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM46AQ96IP4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM46AQ96IP4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM46AQ96IP4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM46AQ96IP4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM46AQ96IP4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM46AQ96IP4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM46AQ96IP4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM46AQ96IP4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM46AQ96IP4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM46AQ96IP4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM46AQ96IP4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM46AQ96IP4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM46AQ96IP4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM46AQ96IP4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM46AQ96IP4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM46AQ96IP4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM46AQ96IP4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM46AQ96IP4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM46AQ96IP4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM46AQ96IP4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM46AQ96IP4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM46AQ96IP4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM46AQ96IP4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM46AQ96IP4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM46AQ96IP4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM46AQ96IP4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM46AQ96IP4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM46AQ96IP4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM46AQ96IP4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM46AQ96IP4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM46AQ96IP4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM46AQ96IP4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM46AQ96IP4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM46AQ96IP4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM46AQ96IP4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM46AQ96IP4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM46AQ96IP4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM46AQ96IP4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM46AQ96IP4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM46AQ96IP4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM46AQ96IP4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM46AQ96IP4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM46AQ96IP4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM46AQ96IP4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM46AQ96IP4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM46AQ96IP4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM46AQ96IP4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM46AQ96IP4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM46AQ96IP4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM46AQ96IP4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM46AQ96IP4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM46AQ96IP4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM46AQ96IP4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM46AQ96IP4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM46AQ96IP4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM46AQ96IP4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
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