Protein–RNA interactions for Protein: Q96I34

PPP1R16A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 16A, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R16AQ96I34 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPP1R16AQ96I34 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPP1R16AQ96I34 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPP1R16AQ96I34 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPP1R16AQ96I34 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPP1R16AQ96I34 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPP1R16AQ96I34 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PPP1R16AQ96I34 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPP1R16AQ96I34 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPP1R16AQ96I34 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPP1R16AQ96I34 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPP1R16AQ96I34 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPP1R16AQ96I34 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPP1R16AQ96I34 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPP1R16AQ96I34 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPP1R16AQ96I34 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPP1R16AQ96I34 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PPP1R16AQ96I34 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PPP1R16AQ96I34 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PPP1R16AQ96I34 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PPP1R16AQ96I34 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPP1R16AQ96I34 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPP1R16AQ96I34 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PPP1R16AQ96I34 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPP1R16AQ96I34 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPP1R16AQ96I34 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPP1R16AQ96I34 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPP1R16AQ96I34 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPP1R16AQ96I34 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPP1R16AQ96I34 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPP1R16AQ96I34 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPP1R16AQ96I34 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPP1R16AQ96I34 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPP1R16AQ96I34 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPP1R16AQ96I34 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPP1R16AQ96I34 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPP1R16AQ96I34 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPP1R16AQ96I34 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPP1R16AQ96I34 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPP1R16AQ96I34 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPP1R16AQ96I34 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PPP1R16AQ96I34 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPP1R16AQ96I34 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PPP1R16AQ96I34 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPP1R16AQ96I34 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP1R16AQ96I34 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP1R16AQ96I34 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP1R16AQ96I34 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP1R16AQ96I34 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP1R16AQ96I34 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP1R16AQ96I34 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP1R16AQ96I34 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP1R16AQ96I34 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP1R16AQ96I34 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP1R16AQ96I34 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP1R16AQ96I34 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP1R16AQ96I34 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP1R16AQ96I34 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP1R16AQ96I34 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP1R16AQ96I34 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP1R16AQ96I34 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP1R16AQ96I34 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP1R16AQ96I34 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP1R16AQ96I34 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP1R16AQ96I34 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP1R16AQ96I34 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP1R16AQ96I34 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP1R16AQ96I34 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP1R16AQ96I34 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PPP1R16AQ96I34 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PPP1R16AQ96I34 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP1R16AQ96I34 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP1R16AQ96I34 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP1R16AQ96I34 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP1R16AQ96I34 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP1R16AQ96I34 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP1R16AQ96I34 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP1R16AQ96I34 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP1R16AQ96I34 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP1R16AQ96I34 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP1R16AQ96I34 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP1R16AQ96I34 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP1R16AQ96I34 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP1R16AQ96I34 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP1R16AQ96I34 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP1R16AQ96I34 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPP1R16AQ96I34 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPP1R16AQ96I34 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPP1R16AQ96I34 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPP1R16AQ96I34 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPP1R16AQ96I34 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPP1R16AQ96I34 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPP1R16AQ96I34 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPP1R16AQ96I34 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPP1R16AQ96I34 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PPP1R16AQ96I34 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPP1R16AQ96I34 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPP1R16AQ96I34 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PPP1R16AQ96I34 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPP1R16AQ96I34 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms