Protein–RNA interactions for Protein: Q96HL8

SH3YL1, SH3 domain-containing YSC84-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3YL1Q96HL8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH3YL1Q96HL8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH3YL1Q96HL8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH3YL1Q96HL8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3YL1Q96HL8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3YL1Q96HL8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3YL1Q96HL8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3YL1Q96HL8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3YL1Q96HL8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3YL1Q96HL8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3YL1Q96HL8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SH3YL1Q96HL8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SH3YL1Q96HL8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SH3YL1Q96HL8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SH3YL1Q96HL8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SH3YL1Q96HL8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH3YL1Q96HL8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH3YL1Q96HL8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3YL1Q96HL8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3YL1Q96HL8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3YL1Q96HL8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3YL1Q96HL8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3YL1Q96HL8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SH3YL1Q96HL8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SH3YL1Q96HL8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH3YL1Q96HL8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH3YL1Q96HL8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH3YL1Q96HL8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH3YL1Q96HL8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3YL1Q96HL8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3YL1Q96HL8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3YL1Q96HL8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3YL1Q96HL8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3YL1Q96HL8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3YL1Q96HL8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3YL1Q96HL8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SH3YL1Q96HL8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SH3YL1Q96HL8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SH3YL1Q96HL8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SH3YL1Q96HL8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SH3YL1Q96HL8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SH3YL1Q96HL8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SH3YL1Q96HL8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SH3YL1Q96HL8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SH3YL1Q96HL8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3YL1Q96HL8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3YL1Q96HL8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3YL1Q96HL8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3YL1Q96HL8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3YL1Q96HL8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3YL1Q96HL8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3YL1Q96HL8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3YL1Q96HL8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3YL1Q96HL8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3YL1Q96HL8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3YL1Q96HL8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3YL1Q96HL8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3YL1Q96HL8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3YL1Q96HL8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3YL1Q96HL8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3YL1Q96HL8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3YL1Q96HL8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3YL1Q96HL8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3YL1Q96HL8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3YL1Q96HL8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3YL1Q96HL8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3YL1Q96HL8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3YL1Q96HL8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3YL1Q96HL8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3YL1Q96HL8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3YL1Q96HL8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3YL1Q96HL8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3YL1Q96HL8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3YL1Q96HL8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3YL1Q96HL8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3YL1Q96HL8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3YL1Q96HL8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3YL1Q96HL8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3YL1Q96HL8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3YL1Q96HL8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3YL1Q96HL8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3YL1Q96HL8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3YL1Q96HL8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3YL1Q96HL8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3YL1Q96HL8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3YL1Q96HL8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3YL1Q96HL8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3YL1Q96HL8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3YL1Q96HL8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3YL1Q96HL8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3YL1Q96HL8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3YL1Q96HL8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3YL1Q96HL8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3YL1Q96HL8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3YL1Q96HL8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3YL1Q96HL8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3YL1Q96HL8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3YL1Q96HL8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3YL1Q96HL8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3YL1Q96HL8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms