Protein–RNA interactions for Protein: Q96FZ5

CMTM7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM7Q96FZ5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CMTM7Q96FZ5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CMTM7Q96FZ5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CMTM7Q96FZ5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CMTM7Q96FZ5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CMTM7Q96FZ5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CMTM7Q96FZ5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CMTM7Q96FZ5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CMTM7Q96FZ5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CMTM7Q96FZ5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CMTM7Q96FZ5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CMTM7Q96FZ5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CMTM7Q96FZ5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CMTM7Q96FZ5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CMTM7Q96FZ5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CMTM7Q96FZ5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CMTM7Q96FZ5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CMTM7Q96FZ5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CMTM7Q96FZ5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CMTM7Q96FZ5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CMTM7Q96FZ5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CMTM7Q96FZ5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CMTM7Q96FZ5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CMTM7Q96FZ5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CMTM7Q96FZ5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CMTM7Q96FZ5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CMTM7Q96FZ5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CMTM7Q96FZ5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CMTM7Q96FZ5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CMTM7Q96FZ5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CMTM7Q96FZ5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CMTM7Q96FZ5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CMTM7Q96FZ5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CMTM7Q96FZ5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CMTM7Q96FZ5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CMTM7Q96FZ5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CMTM7Q96FZ5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CMTM7Q96FZ5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CMTM7Q96FZ5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CMTM7Q96FZ5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CMTM7Q96FZ5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CMTM7Q96FZ5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CMTM7Q96FZ5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CMTM7Q96FZ5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CMTM7Q96FZ5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CMTM7Q96FZ5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CMTM7Q96FZ5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CMTM7Q96FZ5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CMTM7Q96FZ5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CMTM7Q96FZ5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CMTM7Q96FZ5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CMTM7Q96FZ5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CMTM7Q96FZ5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CMTM7Q96FZ5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CMTM7Q96FZ5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CMTM7Q96FZ5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CMTM7Q96FZ5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CMTM7Q96FZ5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CMTM7Q96FZ5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CMTM7Q96FZ5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CMTM7Q96FZ5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CMTM7Q96FZ5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CMTM7Q96FZ5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CMTM7Q96FZ5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CMTM7Q96FZ5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CMTM7Q96FZ5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CMTM7Q96FZ5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CMTM7Q96FZ5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CMTM7Q96FZ5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CMTM7Q96FZ5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CMTM7Q96FZ5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CMTM7Q96FZ5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CMTM7Q96FZ5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CMTM7Q96FZ5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CMTM7Q96FZ5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CMTM7Q96FZ5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CMTM7Q96FZ5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CMTM7Q96FZ5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CMTM7Q96FZ5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CMTM7Q96FZ5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CMTM7Q96FZ5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CMTM7Q96FZ5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CMTM7Q96FZ5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CMTM7Q96FZ5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CMTM7Q96FZ5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CMTM7Q96FZ5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CMTM7Q96FZ5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CMTM7Q96FZ5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CMTM7Q96FZ5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CMTM7Q96FZ5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CMTM7Q96FZ5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CMTM7Q96FZ5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CMTM7Q96FZ5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CMTM7Q96FZ5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CMTM7Q96FZ5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CMTM7Q96FZ5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CMTM7Q96FZ5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CMTM7Q96FZ5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CMTM7Q96FZ5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CMTM7Q96FZ5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms