Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY1

DNAJA3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3Q96EY1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJA3Q96EY1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJA3Q96EY1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNAJA3Q96EY1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNAJA3Q96EY1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms