Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
SIRT1Q96EB6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SIRT1Q96EB6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SIRT1Q96EB6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
SIRT1Q96EB6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
SIRT1Q96EB6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
SIRT1Q96EB6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
SIRT1Q96EB6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
SIRT1Q96EB6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
SIRT1Q96EB6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
SIRT1Q96EB6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC36.31■■■■□ 3.4
SIRT1Q96EB6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SIRT1Q96EB6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SIRT1Q96EB6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
SIRT1Q96EB6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
SIRT1Q96EB6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SIRT1Q96EB6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
SIRT1Q96EB6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
SIRT1Q96EB6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SIRT1Q96EB6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SIRT1Q96EB6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
SIRT1Q96EB6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
SIRT1Q96EB6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
SIRT1Q96EB6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
SIRT1Q96EB6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.39
SIRT1Q96EB6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
SIRT1Q96EB6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
SIRT1Q96EB6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SIRT1Q96EB6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SIRT1Q96EB6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SIRT1Q96EB6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SIRT1Q96EB6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
SIRT1Q96EB6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
SIRT1Q96EB6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SIRT1Q96EB6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SIRT1Q96EB6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SIRT1Q96EB6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SIRT1Q96EB6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SIRT1Q96EB6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
SIRT1Q96EB6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
SIRT1Q96EB6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SIRT1Q96EB6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SIRT1Q96EB6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SIRT1Q96EB6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SIRT1Q96EB6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SIRT1Q96EB6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SIRT1Q96EB6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
SIRT1Q96EB6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SIRT1Q96EB6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SIRT1Q96EB6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SIRT1Q96EB6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
SIRT1Q96EB6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
SIRT1Q96EB6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
SIRT1Q96EB6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SIRT1Q96EB6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
SIRT1Q96EB6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SIRT1Q96EB6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
SIRT1Q96EB6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
SIRT1Q96EB6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
SIRT1Q96EB6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
SIRT1Q96EB6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
SIRT1Q96EB6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
SIRT1Q96EB6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
SIRT1Q96EB6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
SIRT1Q96EB6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SIRT1Q96EB6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SIRT1Q96EB6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SIRT1Q96EB6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
SIRT1Q96EB6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SIRT1Q96EB6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
SIRT1Q96EB6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
SIRT1Q96EB6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SIRT1Q96EB6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
SIRT1Q96EB6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
SIRT1Q96EB6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
SIRT1Q96EB6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
SIRT1Q96EB6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SIRT1Q96EB6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
SIRT1Q96EB6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SIRT1Q96EB6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
SIRT1Q96EB6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
SIRT1Q96EB6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
SIRT1Q96EB6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
SIRT1Q96EB6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
SIRT1Q96EB6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
SIRT1Q96EB6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
SIRT1Q96EB6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
SIRT1Q96EB6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SIRT1Q96EB6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SIRT1Q96EB6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
SIRT1Q96EB6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
SIRT1Q96EB6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SIRT1Q96EB6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SIRT1Q96EB6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SIRT1Q96EB6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
SIRT1Q96EB6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SIRT1Q96EB6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
SIRT1Q96EB6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SIRT1Q96EB6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SIRT1Q96EB6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms