Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C18orf8Q96DM3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
C18orf8Q96DM3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C18orf8Q96DM3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C18orf8Q96DM3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C18orf8Q96DM3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C18orf8Q96DM3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C18orf8Q96DM3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
C18orf8Q96DM3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
C18orf8Q96DM3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C18orf8Q96DM3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C18orf8Q96DM3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C18orf8Q96DM3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C18orf8Q96DM3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
C18orf8Q96DM3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C18orf8Q96DM3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
C18orf8Q96DM3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
C18orf8Q96DM3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
C18orf8Q96DM3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C18orf8Q96DM3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C18orf8Q96DM3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C18orf8Q96DM3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C18orf8Q96DM3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C18orf8Q96DM3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C18orf8Q96DM3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C18orf8Q96DM3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
C18orf8Q96DM3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C18orf8Q96DM3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C18orf8Q96DM3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
C18orf8Q96DM3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
C18orf8Q96DM3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
C18orf8Q96DM3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
C18orf8Q96DM3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
C18orf8Q96DM3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
C18orf8Q96DM3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
C18orf8Q96DM3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
C18orf8Q96DM3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
C18orf8Q96DM3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
C18orf8Q96DM3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C18orf8Q96DM3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C18orf8Q96DM3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
C18orf8Q96DM3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C18orf8Q96DM3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
C18orf8Q96DM3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
C18orf8Q96DM3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
C18orf8Q96DM3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
C18orf8Q96DM3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
C18orf8Q96DM3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
C18orf8Q96DM3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C18orf8Q96DM3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
C18orf8Q96DM3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
C18orf8Q96DM3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
C18orf8Q96DM3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
C18orf8Q96DM3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
C18orf8Q96DM3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
C18orf8Q96DM3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C18orf8Q96DM3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C18orf8Q96DM3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C18orf8Q96DM3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C18orf8Q96DM3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C18orf8Q96DM3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
C18orf8Q96DM3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
C18orf8Q96DM3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C18orf8Q96DM3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
C18orf8Q96DM3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C18orf8Q96DM3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
C18orf8Q96DM3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
C18orf8Q96DM3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
C18orf8Q96DM3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
C18orf8Q96DM3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
C18orf8Q96DM3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C18orf8Q96DM3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C18orf8Q96DM3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C18orf8Q96DM3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C18orf8Q96DM3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
C18orf8Q96DM3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C18orf8Q96DM3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
C18orf8Q96DM3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
C18orf8Q96DM3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
C18orf8Q96DM3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
C18orf8Q96DM3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
C18orf8Q96DM3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
C18orf8Q96DM3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
C18orf8Q96DM3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
C18orf8Q96DM3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
C18orf8Q96DM3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
C18orf8Q96DM3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
C18orf8Q96DM3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
C18orf8Q96DM3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
C18orf8Q96DM3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
C18orf8Q96DM3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
C18orf8Q96DM3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
C18orf8Q96DM3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
C18orf8Q96DM3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
C18orf8Q96DM3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C18orf8Q96DM3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
C18orf8Q96DM3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
C18orf8Q96DM3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
C18orf8Q96DM3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
C18orf8Q96DM3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.2 ms