Protein–RNA interactions for Protein: Q96DE9

CXorf40B, Protein CXorf40B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf40BQ96DE9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CXorf40BQ96DE9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CXorf40BQ96DE9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXorf40BQ96DE9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXorf40BQ96DE9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CXorf40BQ96DE9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXorf40BQ96DE9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CXorf40BQ96DE9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CXorf40BQ96DE9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CXorf40BQ96DE9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CXorf40BQ96DE9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CXorf40BQ96DE9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CXorf40BQ96DE9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CXorf40BQ96DE9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CXorf40BQ96DE9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CXorf40BQ96DE9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXorf40BQ96DE9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXorf40BQ96DE9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXorf40BQ96DE9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXorf40BQ96DE9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXorf40BQ96DE9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXorf40BQ96DE9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXorf40BQ96DE9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CXorf40BQ96DE9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXorf40BQ96DE9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXorf40BQ96DE9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXorf40BQ96DE9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CXorf40BQ96DE9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CXorf40BQ96DE9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CXorf40BQ96DE9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CXorf40BQ96DE9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXorf40BQ96DE9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXorf40BQ96DE9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXorf40BQ96DE9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CXorf40BQ96DE9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CXorf40BQ96DE9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CXorf40BQ96DE9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CXorf40BQ96DE9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CXorf40BQ96DE9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CXorf40BQ96DE9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CXorf40BQ96DE9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CXorf40BQ96DE9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CXorf40BQ96DE9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CXorf40BQ96DE9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CXorf40BQ96DE9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CXorf40BQ96DE9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CXorf40BQ96DE9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CXorf40BQ96DE9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CXorf40BQ96DE9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CXorf40BQ96DE9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CXorf40BQ96DE9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CXorf40BQ96DE9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CXorf40BQ96DE9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CXorf40BQ96DE9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CXorf40BQ96DE9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CXorf40BQ96DE9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CXorf40BQ96DE9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CXorf40BQ96DE9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CXorf40BQ96DE9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CXorf40BQ96DE9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CXorf40BQ96DE9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CXorf40BQ96DE9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CXorf40BQ96DE9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CXorf40BQ96DE9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CXorf40BQ96DE9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CXorf40BQ96DE9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CXorf40BQ96DE9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CXorf40BQ96DE9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CXorf40BQ96DE9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CXorf40BQ96DE9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CXorf40BQ96DE9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CXorf40BQ96DE9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CXorf40BQ96DE9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CXorf40BQ96DE9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CXorf40BQ96DE9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CXorf40BQ96DE9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CXorf40BQ96DE9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXorf40BQ96DE9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXorf40BQ96DE9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXorf40BQ96DE9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXorf40BQ96DE9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXorf40BQ96DE9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXorf40BQ96DE9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CXorf40BQ96DE9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CXorf40BQ96DE9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CXorf40BQ96DE9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CXorf40BQ96DE9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CXorf40BQ96DE9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CXorf40BQ96DE9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXorf40BQ96DE9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXorf40BQ96DE9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXorf40BQ96DE9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXorf40BQ96DE9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXorf40BQ96DE9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CXorf40BQ96DE9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CXorf40BQ96DE9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CXorf40BQ96DE9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXorf40BQ96DE9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXorf40BQ96DE9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CXorf40BQ96DE9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms