Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KCTD12Q96CX2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KCTD12Q96CX2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCTD12Q96CX2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCTD12Q96CX2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCTD12Q96CX2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCTD12Q96CX2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCTD12Q96CX2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCTD12Q96CX2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCTD12Q96CX2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCTD12Q96CX2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCTD12Q96CX2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCTD12Q96CX2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCTD12Q96CX2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCTD12Q96CX2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCTD12Q96CX2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCTD12Q96CX2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCTD12Q96CX2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCTD12Q96CX2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCTD12Q96CX2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCTD12Q96CX2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCTD12Q96CX2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCTD12Q96CX2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCTD12Q96CX2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCTD12Q96CX2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCTD12Q96CX2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD12Q96CX2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD12Q96CX2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD12Q96CX2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD12Q96CX2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD12Q96CX2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCTD12Q96CX2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD12Q96CX2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD12Q96CX2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD12Q96CX2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KCTD12Q96CX2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCTD12Q96CX2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCTD12Q96CX2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCTD12Q96CX2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCTD12Q96CX2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KCTD12Q96CX2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCTD12Q96CX2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCTD12Q96CX2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCTD12Q96CX2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCTD12Q96CX2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCTD12Q96CX2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCTD12Q96CX2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCTD12Q96CX2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCTD12Q96CX2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCTD12Q96CX2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCTD12Q96CX2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD12Q96CX2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD12Q96CX2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD12Q96CX2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD12Q96CX2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD12Q96CX2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD12Q96CX2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD12Q96CX2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD12Q96CX2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD12Q96CX2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD12Q96CX2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD12Q96CX2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD12Q96CX2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD12Q96CX2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD12Q96CX2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD12Q96CX2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD12Q96CX2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCTD12Q96CX2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCTD12Q96CX2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCTD12Q96CX2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD12Q96CX2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD12Q96CX2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD12Q96CX2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD12Q96CX2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD12Q96CX2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD12Q96CX2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCTD12Q96CX2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCTD12Q96CX2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCTD12Q96CX2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCTD12Q96CX2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCTD12Q96CX2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCTD12Q96CX2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCTD12Q96CX2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCTD12Q96CX2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD12Q96CX2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCTD12Q96CX2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCTD12Q96CX2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCTD12Q96CX2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCTD12Q96CX2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCTD12Q96CX2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCTD12Q96CX2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCTD12Q96CX2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KCTD12Q96CX2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCTD12Q96CX2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCTD12Q96CX2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCTD12Q96CX2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCTD12Q96CX2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCTD12Q96CX2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCTD12Q96CX2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCTD12Q96CX2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms