Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
GCC1Q96CN9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
GCC1Q96CN9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
GCC1Q96CN9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
GCC1Q96CN9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GCC1Q96CN9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
GCC1Q96CN9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
GCC1Q96CN9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
GCC1Q96CN9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
GCC1Q96CN9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.04■■■□□ 2.72
GCC1Q96CN9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
GCC1Q96CN9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
GCC1Q96CN9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
GCC1Q96CN9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
GCC1Q96CN9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
GCC1Q96CN9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GCC1Q96CN9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GCC1Q96CN9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GCC1Q96CN9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GCC1Q96CN9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
GCC1Q96CN9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
GCC1Q96CN9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
GCC1Q96CN9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
GCC1Q96CN9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
GCC1Q96CN9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GCC1Q96CN9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
GCC1Q96CN9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
GCC1Q96CN9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
GCC1Q96CN9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC31.95■■■□□ 2.7
GCC1Q96CN9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
GCC1Q96CN9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
GCC1Q96CN9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
GCC1Q96CN9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
GCC1Q96CN9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
GCC1Q96CN9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GCC1Q96CN9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
GCC1Q96CN9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GCC1Q96CN9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GCC1Q96CN9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GCC1Q96CN9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
GCC1Q96CN9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
GCC1Q96CN9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
GCC1Q96CN9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
GCC1Q96CN9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
GCC1Q96CN9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
GCC1Q96CN9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
GCC1Q96CN9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
GCC1Q96CN9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
GCC1Q96CN9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
GCC1Q96CN9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
GCC1Q96CN9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
GCC1Q96CN9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
GCC1Q96CN9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
GCC1Q96CN9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
GCC1Q96CN9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GCC1Q96CN9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GCC1Q96CN9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GCC1Q96CN9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GCC1Q96CN9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
GCC1Q96CN9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC31.87■■■□□ 2.69
GCC1Q96CN9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
GCC1Q96CN9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GCC1Q96CN9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GCC1Q96CN9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
GCC1Q96CN9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
GCC1Q96CN9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
GCC1Q96CN9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
GCC1Q96CN9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
GCC1Q96CN9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
GCC1Q96CN9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GCC1Q96CN9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
GCC1Q96CN9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
GCC1Q96CN9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
GCC1Q96CN9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
GCC1Q96CN9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
GCC1Q96CN9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
GCC1Q96CN9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
GCC1Q96CN9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
GCC1Q96CN9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
GCC1Q96CN9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
GCC1Q96CN9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
GCC1Q96CN9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
GCC1Q96CN9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
GCC1Q96CN9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
GCC1Q96CN9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
GCC1Q96CN9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GCC1Q96CN9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GCC1Q96CN9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GCC1Q96CN9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
GCC1Q96CN9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
GCC1Q96CN9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
GCC1Q96CN9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC31.76■■■□□ 2.67
GCC1Q96CN9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
GCC1Q96CN9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
GCC1Q96CN9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
GCC1Q96CN9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
GCC1Q96CN9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
GCC1Q96CN9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
GCC1Q96CN9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
GCC1Q96CN9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms