Protein–RNA interactions for Protein: Q96C74

ROPN1L, Ropporin-1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1LQ96C74 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ROPN1LQ96C74 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ROPN1LQ96C74 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ROPN1LQ96C74 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ROPN1LQ96C74 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ROPN1LQ96C74 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ROPN1LQ96C74 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ROPN1LQ96C74 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ROPN1LQ96C74 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ROPN1LQ96C74 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ROPN1LQ96C74 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ROPN1LQ96C74 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ROPN1LQ96C74 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ROPN1LQ96C74 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ROPN1LQ96C74 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ROPN1LQ96C74 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ROPN1LQ96C74 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ROPN1LQ96C74 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ROPN1LQ96C74 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ROPN1LQ96C74 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ROPN1LQ96C74 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ROPN1LQ96C74 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ROPN1LQ96C74 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ROPN1LQ96C74 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ROPN1LQ96C74 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ROPN1LQ96C74 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ROPN1LQ96C74 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ROPN1LQ96C74 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ROPN1LQ96C74 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ROPN1LQ96C74 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ROPN1LQ96C74 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ROPN1LQ96C74 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ROPN1LQ96C74 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ROPN1LQ96C74 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ROPN1LQ96C74 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ROPN1LQ96C74 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ROPN1LQ96C74 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ROPN1LQ96C74 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ROPN1LQ96C74 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ROPN1LQ96C74 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ROPN1LQ96C74 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ROPN1LQ96C74 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ROPN1LQ96C74 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ROPN1LQ96C74 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ROPN1LQ96C74 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ROPN1LQ96C74 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ROPN1LQ96C74 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ROPN1LQ96C74 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ROPN1LQ96C74 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ROPN1LQ96C74 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ROPN1LQ96C74 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ROPN1LQ96C74 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ROPN1LQ96C74 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ROPN1LQ96C74 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ROPN1LQ96C74 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ROPN1LQ96C74 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ROPN1LQ96C74 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ROPN1LQ96C74 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ROPN1LQ96C74 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ROPN1LQ96C74 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ROPN1LQ96C74 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ROPN1LQ96C74 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ROPN1LQ96C74 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ROPN1LQ96C74 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ROPN1LQ96C74 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ROPN1LQ96C74 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ROPN1LQ96C74 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ROPN1LQ96C74 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ROPN1LQ96C74 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ROPN1LQ96C74 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ROPN1LQ96C74 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ROPN1LQ96C74 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ROPN1LQ96C74 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ROPN1LQ96C74 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ROPN1LQ96C74 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ROPN1LQ96C74 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ROPN1LQ96C74 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ROPN1LQ96C74 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ROPN1LQ96C74 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ROPN1LQ96C74 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ROPN1LQ96C74 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ROPN1LQ96C74 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ROPN1LQ96C74 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ROPN1LQ96C74 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ROPN1LQ96C74 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ROPN1LQ96C74 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ROPN1LQ96C74 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ROPN1LQ96C74 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ROPN1LQ96C74 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ROPN1LQ96C74 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ROPN1LQ96C74 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ROPN1LQ96C74 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ROPN1LQ96C74 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ROPN1LQ96C74 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ROPN1LQ96C74 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ROPN1LQ96C74 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ROPN1LQ96C74 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ROPN1LQ96C74 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ROPN1LQ96C74 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ROPN1LQ96C74 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms