Protein–RNA interactions for Protein: Q96AK3

APOBEC3D, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3DQ96AK3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC3DQ96AK3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC3DQ96AK3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
APOBEC3DQ96AK3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3DQ96AK3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3DQ96AK3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3DQ96AK3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3DQ96AK3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3DQ96AK3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3DQ96AK3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3DQ96AK3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3DQ96AK3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3DQ96AK3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3DQ96AK3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3DQ96AK3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3DQ96AK3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3DQ96AK3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC3DQ96AK3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC3DQ96AK3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC3DQ96AK3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC3DQ96AK3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC3DQ96AK3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC3DQ96AK3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC3DQ96AK3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC3DQ96AK3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3DQ96AK3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3DQ96AK3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3DQ96AK3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3DQ96AK3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3DQ96AK3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3DQ96AK3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3DQ96AK3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3DQ96AK3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3DQ96AK3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3DQ96AK3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3DQ96AK3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3DQ96AK3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3DQ96AK3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3DQ96AK3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3DQ96AK3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3DQ96AK3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3DQ96AK3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3DQ96AK3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3DQ96AK3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3DQ96AK3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC3DQ96AK3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC3DQ96AK3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC3DQ96AK3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC3DQ96AK3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC3DQ96AK3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC3DQ96AK3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3DQ96AK3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3DQ96AK3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3DQ96AK3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC3DQ96AK3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC3DQ96AK3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC3DQ96AK3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC3DQ96AK3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC3DQ96AK3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3DQ96AK3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3DQ96AK3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3DQ96AK3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3DQ96AK3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3DQ96AK3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3DQ96AK3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3DQ96AK3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC3DQ96AK3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3DQ96AK3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3DQ96AK3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3DQ96AK3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3DQ96AK3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3DQ96AK3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3DQ96AK3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3DQ96AK3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOBEC3DQ96AK3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBEC3DQ96AK3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOBEC3DQ96AK3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC3DQ96AK3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOBEC3DQ96AK3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3DQ96AK3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3DQ96AK3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3DQ96AK3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3DQ96AK3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3DQ96AK3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOBEC3DQ96AK3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC3DQ96AK3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC3DQ96AK3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC3DQ96AK3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC3DQ96AK3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC3DQ96AK3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC3DQ96AK3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC3DQ96AK3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3DQ96AK3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3DQ96AK3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3DQ96AK3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3DQ96AK3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3DQ96AK3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3DQ96AK3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3DQ96AK3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3DQ96AK3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms