Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMARCE1Q969G3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMARCE1Q969G3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCE1Q969G3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMARCE1Q969G3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMARCE1Q969G3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMARCE1Q969G3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMARCE1Q969G3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCE1Q969G3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCE1Q969G3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCE1Q969G3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCE1Q969G3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCE1Q969G3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMARCE1Q969G3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMARCE1Q969G3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMARCE1Q969G3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMARCE1Q969G3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMARCE1Q969G3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMARCE1Q969G3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SMARCE1Q969G3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SMARCE1Q969G3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMARCE1Q969G3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMARCE1Q969G3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMARCE1Q969G3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SMARCE1Q969G3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMARCE1Q969G3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMARCE1Q969G3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMARCE1Q969G3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMARCE1Q969G3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMARCE1Q969G3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SMARCE1Q969G3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMARCE1Q969G3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMARCE1Q969G3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMARCE1Q969G3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SMARCE1Q969G3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMARCE1Q969G3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMARCE1Q969G3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMARCE1Q969G3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMARCE1Q969G3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMARCE1Q969G3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMARCE1Q969G3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMARCE1Q969G3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SMARCE1Q969G3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMARCE1Q969G3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMARCE1Q969G3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMARCE1Q969G3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMARCE1Q969G3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMARCE1Q969G3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMARCE1Q969G3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMARCE1Q969G3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMARCE1Q969G3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMARCE1Q969G3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMARCE1Q969G3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMARCE1Q969G3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCE1Q969G3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCE1Q969G3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCE1Q969G3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMARCE1Q969G3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMARCE1Q969G3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCE1Q969G3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCE1Q969G3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCE1Q969G3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCE1Q969G3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCE1Q969G3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCE1Q969G3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCE1Q969G3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCE1Q969G3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCE1Q969G3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCE1Q969G3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCE1Q969G3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCE1Q969G3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMARCE1Q969G3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMARCE1Q969G3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMARCE1Q969G3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCE1Q969G3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMARCE1Q969G3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCE1Q969G3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCE1Q969G3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCE1Q969G3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCE1Q969G3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCE1Q969G3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCE1Q969G3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMARCE1Q969G3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCE1Q969G3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCE1Q969G3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCE1Q969G3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCE1Q969G3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMARCE1Q969G3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMARCE1Q969G3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMARCE1Q969G3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMARCE1Q969G3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SMARCE1Q969G3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCE1Q969G3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCE1Q969G3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCE1Q969G3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCE1Q969G3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCE1Q969G3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCE1Q969G3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCE1Q969G3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCE1Q969G3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms