Protein–RNA interactions for Protein: Q969D9

TSLP, Thymic stromal lymphopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSLPQ969D9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSLPQ969D9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TSLPQ969D9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSLPQ969D9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSLPQ969D9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSLPQ969D9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSLPQ969D9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSLPQ969D9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSLPQ969D9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSLPQ969D9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSLPQ969D9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSLPQ969D9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSLPQ969D9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSLPQ969D9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSLPQ969D9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSLPQ969D9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TSLPQ969D9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSLPQ969D9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSLPQ969D9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSLPQ969D9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSLPQ969D9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSLPQ969D9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSLPQ969D9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TSLPQ969D9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSLPQ969D9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSLPQ969D9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSLPQ969D9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSLPQ969D9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSLPQ969D9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSLPQ969D9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSLPQ969D9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSLPQ969D9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSLPQ969D9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSLPQ969D9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TSLPQ969D9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSLPQ969D9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSLPQ969D9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSLPQ969D9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSLPQ969D9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSLPQ969D9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSLPQ969D9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSLPQ969D9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSLPQ969D9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSLPQ969D9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSLPQ969D9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSLPQ969D9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TSLPQ969D9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSLPQ969D9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSLPQ969D9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSLPQ969D9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSLPQ969D9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSLPQ969D9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSLPQ969D9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TSLPQ969D9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSLPQ969D9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TSLPQ969D9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSLPQ969D9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TSLPQ969D9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TSLPQ969D9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSLPQ969D9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSLPQ969D9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSLPQ969D9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TSLPQ969D9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSLPQ969D9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSLPQ969D9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSLPQ969D9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TSLPQ969D9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSLPQ969D9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSLPQ969D9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSLPQ969D9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSLPQ969D9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSLPQ969D9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSLPQ969D9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSLPQ969D9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSLPQ969D9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSLPQ969D9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSLPQ969D9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSLPQ969D9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
TSLPQ969D9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TSLPQ969D9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TSLPQ969D9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSLPQ969D9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSLPQ969D9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSLPQ969D9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSLPQ969D9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSLPQ969D9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSLPQ969D9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSLPQ969D9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSLPQ969D9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSLPQ969D9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSLPQ969D9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSLPQ969D9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSLPQ969D9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSLPQ969D9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSLPQ969D9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSLPQ969D9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSLPQ969D9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TSLPQ969D9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSLPQ969D9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSLPQ969D9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms