Protein–RNA interactions for Protein: Q92903

CDS1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDS1Q92903 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDS1Q92903 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDS1Q92903 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDS1Q92903 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CDS1Q92903 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDS1Q92903 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDS1Q92903 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDS1Q92903 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDS1Q92903 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDS1Q92903 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDS1Q92903 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDS1Q92903 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDS1Q92903 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDS1Q92903 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDS1Q92903 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDS1Q92903 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDS1Q92903 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDS1Q92903 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CDS1Q92903 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDS1Q92903 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDS1Q92903 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDS1Q92903 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDS1Q92903 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDS1Q92903 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDS1Q92903 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDS1Q92903 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDS1Q92903 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDS1Q92903 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDS1Q92903 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CDS1Q92903 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDS1Q92903 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDS1Q92903 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDS1Q92903 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDS1Q92903 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDS1Q92903 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDS1Q92903 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CDS1Q92903 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDS1Q92903 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDS1Q92903 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDS1Q92903 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CDS1Q92903 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDS1Q92903 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDS1Q92903 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDS1Q92903 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDS1Q92903 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDS1Q92903 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDS1Q92903 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDS1Q92903 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDS1Q92903 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDS1Q92903 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDS1Q92903 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDS1Q92903 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDS1Q92903 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDS1Q92903 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDS1Q92903 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDS1Q92903 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDS1Q92903 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDS1Q92903 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDS1Q92903 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDS1Q92903 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDS1Q92903 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDS1Q92903 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDS1Q92903 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDS1Q92903 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDS1Q92903 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDS1Q92903 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDS1Q92903 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDS1Q92903 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDS1Q92903 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDS1Q92903 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDS1Q92903 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDS1Q92903 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDS1Q92903 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CDS1Q92903 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDS1Q92903 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDS1Q92903 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDS1Q92903 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDS1Q92903 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDS1Q92903 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDS1Q92903 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDS1Q92903 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDS1Q92903 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDS1Q92903 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CDS1Q92903 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDS1Q92903 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDS1Q92903 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDS1Q92903 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDS1Q92903 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDS1Q92903 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDS1Q92903 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDS1Q92903 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDS1Q92903 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDS1Q92903 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDS1Q92903 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDS1Q92903 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CDS1Q92903 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDS1Q92903 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDS1Q92903 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDS1Q92903 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDS1Q92903 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms