Protein–RNA interactions for Protein: Q92902

HPS1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1Q92902 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HPS1Q92902 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HPS1Q92902 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HPS1Q92902 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS1Q92902 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS1Q92902 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS1Q92902 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS1Q92902 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS1Q92902 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPS1Q92902 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPS1Q92902 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPS1Q92902 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPS1Q92902 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS1Q92902 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPS1Q92902 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS1Q92902 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS1Q92902 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS1Q92902 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS1Q92902 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS1Q92902 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS1Q92902 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS1Q92902 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HPS1Q92902 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPS1Q92902 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPS1Q92902 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPS1Q92902 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPS1Q92902 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPS1Q92902 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPS1Q92902 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPS1Q92902 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPS1Q92902 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPS1Q92902 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPS1Q92902 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPS1Q92902 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPS1Q92902 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPS1Q92902 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS1Q92902 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS1Q92902 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS1Q92902 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS1Q92902 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS1Q92902 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS1Q92902 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS1Q92902 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPS1Q92902 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS1Q92902 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS1Q92902 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS1Q92902 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS1Q92902 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPS1Q92902 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS1Q92902 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS1Q92902 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS1Q92902 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS1Q92902 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPS1Q92902 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS1Q92902 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS1Q92902 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS1Q92902 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS1Q92902 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPS1Q92902 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPS1Q92902 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS1Q92902 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS1Q92902 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS1Q92902 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS1Q92902 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS1Q92902 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS1Q92902 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS1Q92902 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS1Q92902 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS1Q92902 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS1Q92902 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS1Q92902 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS1Q92902 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS1Q92902 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPS1Q92902 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPS1Q92902 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS1Q92902 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS1Q92902 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS1Q92902 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS1Q92902 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS1Q92902 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS1Q92902 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPS1Q92902 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPS1Q92902 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPS1Q92902 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPS1Q92902 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HPS1Q92902 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPS1Q92902 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPS1Q92902 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPS1Q92902 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPS1Q92902 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HPS1Q92902 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPS1Q92902 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPS1Q92902 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPS1Q92902 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS1Q92902 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS1Q92902 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS1Q92902 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS1Q92902 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS1Q92902 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HPS1Q92902 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms