Protein–RNA interactions for Protein: Q92764

KRT35, Keratin, type I cuticular Ha5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT35Q92764 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT35Q92764 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT35Q92764 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT35Q92764 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT35Q92764 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT35Q92764 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT35Q92764 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
KRT35Q92764 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KRT35Q92764 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT35Q92764 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT35Q92764 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT35Q92764 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT35Q92764 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT35Q92764 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT35Q92764 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT35Q92764 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT35Q92764 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT35Q92764 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT35Q92764 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT35Q92764 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT35Q92764 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT35Q92764 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT35Q92764 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT35Q92764 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT35Q92764 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT35Q92764 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT35Q92764 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT35Q92764 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT35Q92764 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT35Q92764 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT35Q92764 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT35Q92764 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT35Q92764 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT35Q92764 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT35Q92764 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT35Q92764 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT35Q92764 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT35Q92764 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT35Q92764 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT35Q92764 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT35Q92764 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT35Q92764 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT35Q92764 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT35Q92764 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT35Q92764 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT35Q92764 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT35Q92764 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT35Q92764 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT35Q92764 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT35Q92764 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT35Q92764 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT35Q92764 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT35Q92764 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT35Q92764 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT35Q92764 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT35Q92764 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT35Q92764 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT35Q92764 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT35Q92764 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
KRT35Q92764 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT35Q92764 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT35Q92764 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT35Q92764 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT35Q92764 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT35Q92764 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT35Q92764 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT35Q92764 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT35Q92764 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT35Q92764 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT35Q92764 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT35Q92764 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT35Q92764 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT35Q92764 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT35Q92764 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT35Q92764 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT35Q92764 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT35Q92764 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT35Q92764 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KRT35Q92764 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT35Q92764 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT35Q92764 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT35Q92764 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT35Q92764 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT35Q92764 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT35Q92764 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT35Q92764 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT35Q92764 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT35Q92764 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT35Q92764 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT35Q92764 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT35Q92764 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT35Q92764 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT35Q92764 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT35Q92764 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT35Q92764 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT35Q92764 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT35Q92764 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT35Q92764 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT35Q92764 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT35Q92764 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms