Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TAF4BQ92750 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TAF4BQ92750 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TAF4BQ92750 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TAF4BQ92750 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TAF4BQ92750 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TAF4BQ92750 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TAF4BQ92750 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TAF4BQ92750 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TAF4BQ92750 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TAF4BQ92750 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TAF4BQ92750 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TAF4BQ92750 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TAF4BQ92750 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TAF4BQ92750 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TAF4BQ92750 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
TAF4BQ92750 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TAF4BQ92750 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TAF4BQ92750 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TAF4BQ92750 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TAF4BQ92750 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TAF4BQ92750 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TAF4BQ92750 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TAF4BQ92750 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TAF4BQ92750 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TAF4BQ92750 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TAF4BQ92750 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TAF4BQ92750 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TAF4BQ92750 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TAF4BQ92750 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TAF4BQ92750 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TAF4BQ92750 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TAF4BQ92750 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TAF4BQ92750 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TAF4BQ92750 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TAF4BQ92750 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TAF4BQ92750 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TAF4BQ92750 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TAF4BQ92750 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TAF4BQ92750 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TAF4BQ92750 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TAF4BQ92750 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TAF4BQ92750 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TAF4BQ92750 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TAF4BQ92750 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TAF4BQ92750 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TAF4BQ92750 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TAF4BQ92750 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TAF4BQ92750 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
TAF4BQ92750 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TAF4BQ92750 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TAF4BQ92750 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TAF4BQ92750 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TAF4BQ92750 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TAF4BQ92750 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TAF4BQ92750 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TAF4BQ92750 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TAF4BQ92750 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TAF4BQ92750 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TAF4BQ92750 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TAF4BQ92750 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TAF4BQ92750 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TAF4BQ92750 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TAF4BQ92750 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TAF4BQ92750 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TAF4BQ92750 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TAF4BQ92750 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TAF4BQ92750 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TAF4BQ92750 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TAF4BQ92750 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TAF4BQ92750 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TAF4BQ92750 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TAF4BQ92750 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TAF4BQ92750 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TAF4BQ92750 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TAF4BQ92750 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TAF4BQ92750 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TAF4BQ92750 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TAF4BQ92750 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TAF4BQ92750 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TAF4BQ92750 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TAF4BQ92750 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TAF4BQ92750 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TAF4BQ92750 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TAF4BQ92750 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TAF4BQ92750 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TAF4BQ92750 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TAF4BQ92750 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TAF4BQ92750 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TAF4BQ92750 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TAF4BQ92750 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TAF4BQ92750 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TAF4BQ92750 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TAF4BQ92750 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TAF4BQ92750 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TAF4BQ92750 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TAF4BQ92750 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TAF4BQ92750 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TAF4BQ92750 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TAF4BQ92750 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms