Protein–RNA interactions for Protein: Q92622

RUBCN, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCNQ92622 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RUBCNQ92622 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RUBCNQ92622 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RUBCNQ92622 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RUBCNQ92622 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RUBCNQ92622 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RUBCNQ92622 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RUBCNQ92622 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RUBCNQ92622 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RUBCNQ92622 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RUBCNQ92622 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RUBCNQ92622 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RUBCNQ92622 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RUBCNQ92622 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RUBCNQ92622 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RUBCNQ92622 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RUBCNQ92622 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RUBCNQ92622 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RUBCNQ92622 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RUBCNQ92622 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RUBCNQ92622 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RUBCNQ92622 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RUBCNQ92622 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RUBCNQ92622 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RUBCNQ92622 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RUBCNQ92622 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RUBCNQ92622 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RUBCNQ92622 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RUBCNQ92622 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RUBCNQ92622 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RUBCNQ92622 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RUBCNQ92622 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RUBCNQ92622 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RUBCNQ92622 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RUBCNQ92622 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RUBCNQ92622 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RUBCNQ92622 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RUBCNQ92622 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUBCNQ92622 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUBCNQ92622 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUBCNQ92622 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUBCNQ92622 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RUBCNQ92622 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RUBCNQ92622 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RUBCNQ92622 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RUBCNQ92622 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RUBCNQ92622 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUBCNQ92622 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUBCNQ92622 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUBCNQ92622 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUBCNQ92622 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RUBCNQ92622 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RUBCNQ92622 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RUBCNQ92622 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RUBCNQ92622 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RUBCNQ92622 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RUBCNQ92622 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUBCNQ92622 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUBCNQ92622 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUBCNQ92622 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUBCNQ92622 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RUBCNQ92622 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RUBCNQ92622 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RUBCNQ92622 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RUBCNQ92622 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RUBCNQ92622 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RUBCNQ92622 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RUBCNQ92622 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RUBCNQ92622 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RUBCNQ92622 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RUBCNQ92622 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RUBCNQ92622 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RUBCNQ92622 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RUBCNQ92622 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RUBCNQ92622 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RUBCNQ92622 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RUBCNQ92622 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RUBCNQ92622 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RUBCNQ92622 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RUBCNQ92622 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RUBCNQ92622 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RUBCNQ92622 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RUBCNQ92622 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RUBCNQ92622 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RUBCNQ92622 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RUBCNQ92622 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUBCNQ92622 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUBCNQ92622 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUBCNQ92622 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RUBCNQ92622 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RUBCNQ92622 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RUBCNQ92622 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RUBCNQ92622 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RUBCNQ92622 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RUBCNQ92622 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RUBCNQ92622 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RUBCNQ92622 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RUBCNQ92622 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
RUBCNQ92622 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RUBCNQ92622 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms