Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TSC1Q92574 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TSC1Q92574 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TSC1Q92574 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TSC1Q92574 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TSC1Q92574 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TSC1Q92574 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TSC1Q92574 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSC1Q92574 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSC1Q92574 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSC1Q92574 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSC1Q92574 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TSC1Q92574 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TSC1Q92574 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TSC1Q92574 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TSC1Q92574 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSC1Q92574 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSC1Q92574 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSC1Q92574 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSC1Q92574 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TSC1Q92574 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TSC1Q92574 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TSC1Q92574 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSC1Q92574 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSC1Q92574 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSC1Q92574 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TSC1Q92574 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TSC1Q92574 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TSC1Q92574 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSC1Q92574 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSC1Q92574 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSC1Q92574 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSC1Q92574 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TSC1Q92574 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TSC1Q92574 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TSC1Q92574 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TSC1Q92574 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TSC1Q92574 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TSC1Q92574 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TSC1Q92574 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TSC1Q92574 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TSC1Q92574 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TSC1Q92574 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TSC1Q92574 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TSC1Q92574 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TSC1Q92574 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TSC1Q92574 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TSC1Q92574 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TSC1Q92574 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TSC1Q92574 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TSC1Q92574 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TSC1Q92574 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TSC1Q92574 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TSC1Q92574 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TSC1Q92574 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TSC1Q92574 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TSC1Q92574 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TSC1Q92574 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TSC1Q92574 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TSC1Q92574 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TSC1Q92574 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TSC1Q92574 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TSC1Q92574 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TSC1Q92574 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TSC1Q92574 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TSC1Q92574 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TSC1Q92574 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TSC1Q92574 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TSC1Q92574 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSC1Q92574 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSC1Q92574 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TSC1Q92574 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TSC1Q92574 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TSC1Q92574 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TSC1Q92574 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TSC1Q92574 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TSC1Q92574 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TSC1Q92574 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TSC1Q92574 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSC1Q92574 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSC1Q92574 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSC1Q92574 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSC1Q92574 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSC1Q92574 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSC1Q92574 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSC1Q92574 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSC1Q92574 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSC1Q92574 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSC1Q92574 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSC1Q92574 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TSC1Q92574 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TSC1Q92574 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TSC1Q92574 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TSC1Q92574 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TSC1Q92574 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSC1Q92574 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TSC1Q92574 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSC1Q92574 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSC1Q92574 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TSC1Q92574 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms