Protein–RNA interactions for Protein: Q92572

AP3S1, AP-3 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S1Q92572 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP3S1Q92572 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP3S1Q92572 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AP3S1Q92572 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP3S1Q92572 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP3S1Q92572 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP3S1Q92572 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP3S1Q92572 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP3S1Q92572 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP3S1Q92572 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP3S1Q92572 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP3S1Q92572 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP3S1Q92572 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP3S1Q92572 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP3S1Q92572 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3S1Q92572 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3S1Q92572 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3S1Q92572 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3S1Q92572 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3S1Q92572 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3S1Q92572 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP3S1Q92572 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP3S1Q92572 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP3S1Q92572 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP3S1Q92572 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP3S1Q92572 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3S1Q92572 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3S1Q92572 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3S1Q92572 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3S1Q92572 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3S1Q92572 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3S1Q92572 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3S1Q92572 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3S1Q92572 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3S1Q92572 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3S1Q92572 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3S1Q92572 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3S1Q92572 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3S1Q92572 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3S1Q92572 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3S1Q92572 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3S1Q92572 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3S1Q92572 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3S1Q92572 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3S1Q92572 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3S1Q92572 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3S1Q92572 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3S1Q92572 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3S1Q92572 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3S1Q92572 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3S1Q92572 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3S1Q92572 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3S1Q92572 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3S1Q92572 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3S1Q92572 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3S1Q92572 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3S1Q92572 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP3S1Q92572 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP3S1Q92572 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3S1Q92572 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3S1Q92572 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3S1Q92572 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3S1Q92572 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3S1Q92572 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3S1Q92572 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3S1Q92572 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3S1Q92572 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3S1Q92572 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3S1Q92572 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3S1Q92572 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3S1Q92572 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3S1Q92572 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3S1Q92572 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3S1Q92572 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3S1Q92572 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3S1Q92572 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3S1Q92572 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3S1Q92572 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3S1Q92572 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3S1Q92572 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3S1Q92572 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3S1Q92572 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3S1Q92572 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3S1Q92572 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3S1Q92572 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3S1Q92572 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3S1Q92572 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3S1Q92572 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3S1Q92572 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3S1Q92572 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3S1Q92572 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3S1Q92572 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3S1Q92572 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3S1Q92572 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3S1Q92572 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3S1Q92572 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3S1Q92572 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
AP3S1Q92572 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AP3S1Q92572 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
AP3S1Q92572 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms