Protein–RNA interactions for Protein: Q92544

TM9SF4, Transmembrane 9 superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF4Q92544 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM9SF4Q92544 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM9SF4Q92544 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM9SF4Q92544 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM9SF4Q92544 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM9SF4Q92544 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM9SF4Q92544 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM9SF4Q92544 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM9SF4Q92544 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM9SF4Q92544 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM9SF4Q92544 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM9SF4Q92544 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM9SF4Q92544 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM9SF4Q92544 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM9SF4Q92544 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM9SF4Q92544 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM9SF4Q92544 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TM9SF4Q92544 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TM9SF4Q92544 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM9SF4Q92544 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM9SF4Q92544 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM9SF4Q92544 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM9SF4Q92544 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM9SF4Q92544 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM9SF4Q92544 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TM9SF4Q92544 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM9SF4Q92544 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM9SF4Q92544 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM9SF4Q92544 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM9SF4Q92544 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM9SF4Q92544 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM9SF4Q92544 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM9SF4Q92544 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM9SF4Q92544 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM9SF4Q92544 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM9SF4Q92544 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM9SF4Q92544 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM9SF4Q92544 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM9SF4Q92544 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM9SF4Q92544 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM9SF4Q92544 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM9SF4Q92544 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM9SF4Q92544 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM9SF4Q92544 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM9SF4Q92544 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM9SF4Q92544 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM9SF4Q92544 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM9SF4Q92544 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM9SF4Q92544 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM9SF4Q92544 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM9SF4Q92544 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM9SF4Q92544 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM9SF4Q92544 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM9SF4Q92544 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM9SF4Q92544 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TM9SF4Q92544 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TM9SF4Q92544 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TM9SF4Q92544 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TM9SF4Q92544 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TM9SF4Q92544 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM9SF4Q92544 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM9SF4Q92544 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TM9SF4Q92544 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM9SF4Q92544 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM9SF4Q92544 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM9SF4Q92544 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TM9SF4Q92544 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TM9SF4Q92544 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TM9SF4Q92544 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TM9SF4Q92544 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TM9SF4Q92544 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TM9SF4Q92544 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TM9SF4Q92544 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TM9SF4Q92544 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TM9SF4Q92544 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TM9SF4Q92544 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TM9SF4Q92544 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TM9SF4Q92544 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TM9SF4Q92544 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TM9SF4Q92544 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TM9SF4Q92544 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TM9SF4Q92544 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM9SF4Q92544 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM9SF4Q92544 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM9SF4Q92544 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM9SF4Q92544 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM9SF4Q92544 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM9SF4Q92544 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TM9SF4Q92544 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TM9SF4Q92544 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TM9SF4Q92544 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TM9SF4Q92544 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TM9SF4Q92544 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TM9SF4Q92544 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TM9SF4Q92544 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TM9SF4Q92544 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM9SF4Q92544 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM9SF4Q92544 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM9SF4Q92544 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM9SF4Q92544 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms