Protein–RNA interactions for Protein: Q923S9

Rab30, Ras-related protein Rab-30, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab30Q923S9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rab30Q923S9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rab30Q923S9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rab30Q923S9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rab30Q923S9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rab30Q923S9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rab30Q923S9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rab30Q923S9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rab30Q923S9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rab30Q923S9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Rab30Q923S9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rab30Q923S9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rab30Q923S9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Rab30Q923S9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rab30Q923S9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rab30Q923S9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rab30Q923S9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rab30Q923S9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Rab30Q923S9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rab30Q923S9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rab30Q923S9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rab30Q923S9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rab30Q923S9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rab30Q923S9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab30Q923S9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab30Q923S9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab30Q923S9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab30Q923S9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab30Q923S9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rab30Q923S9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rab30Q923S9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rab30Q923S9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rab30Q923S9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab30Q923S9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab30Q923S9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab30Q923S9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab30Q923S9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab30Q923S9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab30Q923S9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab30Q923S9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab30Q923S9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab30Q923S9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab30Q923S9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rab30Q923S9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab30Q923S9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab30Q923S9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab30Q923S9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rab30Q923S9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rab30Q923S9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rab30Q923S9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rab30Q923S9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rab30Q923S9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab30Q923S9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab30Q923S9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab30Q923S9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab30Q923S9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rab30Q923S9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rab30Q923S9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab30Q923S9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab30Q923S9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab30Q923S9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab30Q923S9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab30Q923S9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Rab30Q923S9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rab30Q923S9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rab30Q923S9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Rab30Q923S9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rab30Q923S9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rab30Q923S9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab30Q923S9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab30Q923S9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab30Q923S9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rab30Q923S9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Rab30Q923S9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rab30Q923S9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab30Q923S9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab30Q923S9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rab30Q923S9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rab30Q923S9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rab30Q923S9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rab30Q923S9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rab30Q923S9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab30Q923S9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab30Q923S9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab30Q923S9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Rab30Q923S9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rab30Q923S9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rab30Q923S9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rab30Q923S9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rab30Q923S9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rab30Q923S9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rab30Q923S9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rab30Q923S9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab30Q923S9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab30Q923S9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rab30Q923S9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rab30Q923S9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rab30Q923S9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rab30Q923S9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rab30Q923S9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms