Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TardbpQ921F2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TardbpQ921F2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TardbpQ921F2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TardbpQ921F2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TardbpQ921F2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TardbpQ921F2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TardbpQ921F2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TardbpQ921F2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TardbpQ921F2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TardbpQ921F2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TardbpQ921F2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TardbpQ921F2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TardbpQ921F2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TardbpQ921F2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TardbpQ921F2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TardbpQ921F2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TardbpQ921F2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TardbpQ921F2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TardbpQ921F2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TardbpQ921F2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TardbpQ921F2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TardbpQ921F2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TardbpQ921F2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TardbpQ921F2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TardbpQ921F2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TardbpQ921F2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TardbpQ921F2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TardbpQ921F2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TardbpQ921F2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TardbpQ921F2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TardbpQ921F2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TardbpQ921F2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TardbpQ921F2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TardbpQ921F2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TardbpQ921F2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TardbpQ921F2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TardbpQ921F2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TardbpQ921F2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TardbpQ921F2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TardbpQ921F2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TardbpQ921F2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TardbpQ921F2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TardbpQ921F2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TardbpQ921F2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TardbpQ921F2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TardbpQ921F2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TardbpQ921F2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TardbpQ921F2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TardbpQ921F2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TardbpQ921F2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TardbpQ921F2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TardbpQ921F2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TardbpQ921F2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TardbpQ921F2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TardbpQ921F2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TardbpQ921F2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TardbpQ921F2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TardbpQ921F2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TardbpQ921F2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TardbpQ921F2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TardbpQ921F2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TardbpQ921F2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TardbpQ921F2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TardbpQ921F2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TardbpQ921F2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TardbpQ921F2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TardbpQ921F2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TardbpQ921F2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TardbpQ921F2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TardbpQ921F2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TardbpQ921F2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TardbpQ921F2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TardbpQ921F2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TardbpQ921F2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TardbpQ921F2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TardbpQ921F2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TardbpQ921F2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TardbpQ921F2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TardbpQ921F2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TardbpQ921F2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TardbpQ921F2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TardbpQ921F2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TardbpQ921F2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TardbpQ921F2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TardbpQ921F2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TardbpQ921F2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TardbpQ921F2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TardbpQ921F2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TardbpQ921F2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TardbpQ921F2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TardbpQ921F2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TardbpQ921F2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TardbpQ921F2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TardbpQ921F2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TardbpQ921F2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TardbpQ921F2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TardbpQ921F2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TardbpQ921F2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TardbpQ921F2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.1 ms