Protein–RNA interactions for Protein: Q91Z38

Ttc1, Tetratricopeptide repeat protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc1Q91Z38 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ttc1Q91Z38 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ttc1Q91Z38 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc1Q91Z38 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc1Q91Z38 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc1Q91Z38 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc1Q91Z38 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc1Q91Z38 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttc1Q91Z38 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc1Q91Z38 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc1Q91Z38 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc1Q91Z38 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttc1Q91Z38 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttc1Q91Z38 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttc1Q91Z38 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttc1Q91Z38 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttc1Q91Z38 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttc1Q91Z38 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttc1Q91Z38 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc1Q91Z38 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc1Q91Z38 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc1Q91Z38 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc1Q91Z38 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc1Q91Z38 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc1Q91Z38 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc1Q91Z38 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc1Q91Z38 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc1Q91Z38 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc1Q91Z38 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc1Q91Z38 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc1Q91Z38 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc1Q91Z38 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc1Q91Z38 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc1Q91Z38 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc1Q91Z38 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc1Q91Z38 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc1Q91Z38 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc1Q91Z38 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc1Q91Z38 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttc1Q91Z38 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttc1Q91Z38 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttc1Q91Z38 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttc1Q91Z38 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc1Q91Z38 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc1Q91Z38 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc1Q91Z38 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttc1Q91Z38 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttc1Q91Z38 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttc1Q91Z38 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttc1Q91Z38 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttc1Q91Z38 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttc1Q91Z38 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttc1Q91Z38 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttc1Q91Z38 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttc1Q91Z38 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttc1Q91Z38 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttc1Q91Z38 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ttc1Q91Z38 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ttc1Q91Z38 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ttc1Q91Z38 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ttc1Q91Z38 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ttc1Q91Z38 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ttc1Q91Z38 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ttc1Q91Z38 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc1Q91Z38 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc1Q91Z38 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc1Q91Z38 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc1Q91Z38 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc1Q91Z38 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttc1Q91Z38 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttc1Q91Z38 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttc1Q91Z38 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc1Q91Z38 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc1Q91Z38 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc1Q91Z38 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttc1Q91Z38 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttc1Q91Z38 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ttc1Q91Z38 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc1Q91Z38 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc1Q91Z38 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc1Q91Z38 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc1Q91Z38 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc1Q91Z38 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc1Q91Z38 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc1Q91Z38 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc1Q91Z38 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc1Q91Z38 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc1Q91Z38 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc1Q91Z38 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc1Q91Z38 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttc1Q91Z38 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttc1Q91Z38 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc1Q91Z38 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc1Q91Z38 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc1Q91Z38 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc1Q91Z38 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc1Q91Z38 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc1Q91Z38 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc1Q91Z38 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc1Q91Z38 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 358.7 ms