Protein–RNA interactions for Protein: Q91YQ3

Csdc2, Cold shock domain-containing protein C2, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csdc2Q91YQ3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csdc2Q91YQ3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csdc2Q91YQ3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csdc2Q91YQ3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csdc2Q91YQ3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csdc2Q91YQ3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csdc2Q91YQ3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csdc2Q91YQ3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csdc2Q91YQ3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csdc2Q91YQ3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csdc2Q91YQ3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csdc2Q91YQ3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csdc2Q91YQ3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csdc2Q91YQ3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csdc2Q91YQ3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csdc2Q91YQ3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csdc2Q91YQ3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csdc2Q91YQ3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Csdc2Q91YQ3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csdc2Q91YQ3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csdc2Q91YQ3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csdc2Q91YQ3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csdc2Q91YQ3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csdc2Q91YQ3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Csdc2Q91YQ3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Csdc2Q91YQ3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csdc2Q91YQ3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csdc2Q91YQ3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csdc2Q91YQ3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Csdc2Q91YQ3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csdc2Q91YQ3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csdc2Q91YQ3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csdc2Q91YQ3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms