Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE8

Synpo2, Synaptopodin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synpo2Q91YE8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Synpo2Q91YE8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Synpo2Q91YE8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Synpo2Q91YE8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Synpo2Q91YE8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Synpo2Q91YE8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Synpo2Q91YE8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Synpo2Q91YE8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Synpo2Q91YE8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Synpo2Q91YE8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Synpo2Q91YE8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Synpo2Q91YE8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Synpo2Q91YE8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Synpo2Q91YE8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Synpo2Q91YE8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Synpo2Q91YE8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Synpo2Q91YE8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Synpo2Q91YE8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Synpo2Q91YE8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Synpo2Q91YE8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Synpo2Q91YE8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Synpo2Q91YE8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Synpo2Q91YE8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Synpo2Q91YE8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Synpo2Q91YE8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Synpo2Q91YE8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Synpo2Q91YE8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Synpo2Q91YE8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Synpo2Q91YE8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Synpo2Q91YE8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Synpo2Q91YE8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Synpo2Q91YE8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Synpo2Q91YE8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Synpo2Q91YE8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Synpo2Q91YE8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Synpo2Q91YE8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Synpo2Q91YE8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Synpo2Q91YE8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Synpo2Q91YE8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Synpo2Q91YE8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Synpo2Q91YE8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Synpo2Q91YE8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Synpo2Q91YE8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Synpo2Q91YE8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Synpo2Q91YE8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Synpo2Q91YE8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Synpo2Q91YE8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Synpo2Q91YE8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Synpo2Q91YE8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Synpo2Q91YE8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Synpo2Q91YE8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Synpo2Q91YE8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Synpo2Q91YE8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Synpo2Q91YE8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Synpo2Q91YE8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Synpo2Q91YE8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Synpo2Q91YE8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Synpo2Q91YE8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Synpo2Q91YE8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Synpo2Q91YE8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Synpo2Q91YE8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Synpo2Q91YE8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Synpo2Q91YE8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Synpo2Q91YE8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Synpo2Q91YE8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Synpo2Q91YE8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Synpo2Q91YE8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Synpo2Q91YE8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Synpo2Q91YE8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Synpo2Q91YE8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Synpo2Q91YE8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Synpo2Q91YE8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Synpo2Q91YE8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Synpo2Q91YE8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Synpo2Q91YE8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Synpo2Q91YE8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Synpo2Q91YE8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Synpo2Q91YE8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Synpo2Q91YE8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Synpo2Q91YE8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Synpo2Q91YE8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Synpo2Q91YE8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Synpo2Q91YE8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Synpo2Q91YE8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Synpo2Q91YE8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Synpo2Q91YE8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Synpo2Q91YE8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Synpo2Q91YE8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Synpo2Q91YE8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Synpo2Q91YE8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Synpo2Q91YE8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Synpo2Q91YE8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Synpo2Q91YE8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Synpo2Q91YE8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Synpo2Q91YE8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Synpo2Q91YE8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Synpo2Q91YE8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Synpo2Q91YE8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Synpo2Q91YE8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Synpo2Q91YE8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms