Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y11

Pcdha9, Protocadherin alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha9Q91Y11 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcdha9Q91Y11 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcdha9Q91Y11 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcdha9Q91Y11 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcdha9Q91Y11 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcdha9Q91Y11 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcdha9Q91Y11 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcdha9Q91Y11 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcdha9Q91Y11 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcdha9Q91Y11 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcdha9Q91Y11 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcdha9Q91Y11 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcdha9Q91Y11 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcdha9Q91Y11 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcdha9Q91Y11 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcdha9Q91Y11 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcdha9Q91Y11 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcdha9Q91Y11 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pcdha9Q91Y11 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pcdha9Q91Y11 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcdha9Q91Y11 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcdha9Q91Y11 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcdha9Q91Y11 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcdha9Q91Y11 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcdha9Q91Y11 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcdha9Q91Y11 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcdha9Q91Y11 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcdha9Q91Y11 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcdha9Q91Y11 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pcdha9Q91Y11 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcdha9Q91Y11 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcdha9Q91Y11 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcdha9Q91Y11 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcdha9Q91Y11 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcdha9Q91Y11 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcdha9Q91Y11 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcdha9Q91Y11 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcdha9Q91Y11 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcdha9Q91Y11 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcdha9Q91Y11 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcdha9Q91Y11 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcdha9Q91Y11 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcdha9Q91Y11 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcdha9Q91Y11 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcdha9Q91Y11 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pcdha9Q91Y11 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcdha9Q91Y11 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcdha9Q91Y11 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcdha9Q91Y11 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcdha9Q91Y11 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcdha9Q91Y11 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcdha9Q91Y11 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcdha9Q91Y11 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcdha9Q91Y11 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcdha9Q91Y11 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcdha9Q91Y11 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcdha9Q91Y11 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcdha9Q91Y11 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcdha9Q91Y11 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcdha9Q91Y11 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcdha9Q91Y11 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcdha9Q91Y11 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcdha9Q91Y11 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcdha9Q91Y11 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcdha9Q91Y11 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcdha9Q91Y11 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcdha9Q91Y11 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcdha9Q91Y11 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcdha9Q91Y11 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Pcdha9Q91Y11 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcdha9Q91Y11 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcdha9Q91Y11 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcdha9Q91Y11 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcdha9Q91Y11 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcdha9Q91Y11 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcdha9Q91Y11 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcdha9Q91Y11 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcdha9Q91Y11 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcdha9Q91Y11 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcdha9Q91Y11 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcdha9Q91Y11 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pcdha9Q91Y11 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pcdha9Q91Y11 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcdha9Q91Y11 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcdha9Q91Y11 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcdha9Q91Y11 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcdha9Q91Y11 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcdha9Q91Y11 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcdha9Q91Y11 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcdha9Q91Y11 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcdha9Q91Y11 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcdha9Q91Y11 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcdha9Q91Y11 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcdha9Q91Y11 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcdha9Q91Y11 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcdha9Q91Y11 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcdha9Q91Y11 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcdha9Q91Y11 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Pcdha9Q91Y11 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcdha9Q91Y11 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms