Protein–RNA interactions for Protein: Q91XT4

Sec16b, Protein transport protein Sec16B, mousemouse

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec16bQ91XT4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sec16bQ91XT4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sec16bQ91XT4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sec16bQ91XT4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sec16bQ91XT4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sec16bQ91XT4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sec16bQ91XT4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sec16bQ91XT4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sec16bQ91XT4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sec16bQ91XT4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sec16bQ91XT4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sec16bQ91XT4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sec16bQ91XT4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sec16bQ91XT4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sec16bQ91XT4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sec16bQ91XT4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sec16bQ91XT4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sec16bQ91XT4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sec16bQ91XT4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sec16bQ91XT4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sec16bQ91XT4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sec16bQ91XT4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sec16bQ91XT4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sec16bQ91XT4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sec16bQ91XT4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sec16bQ91XT4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sec16bQ91XT4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sec16bQ91XT4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sec16bQ91XT4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sec16bQ91XT4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sec16bQ91XT4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec16bQ91XT4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec16bQ91XT4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec16bQ91XT4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec16bQ91XT4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec16bQ91XT4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sec16bQ91XT4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sec16bQ91XT4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sec16bQ91XT4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sec16bQ91XT4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sec16bQ91XT4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec16bQ91XT4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec16bQ91XT4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec16bQ91XT4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec16bQ91XT4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec16bQ91XT4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec16bQ91XT4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec16bQ91XT4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sec16bQ91XT4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sec16bQ91XT4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sec16bQ91XT4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sec16bQ91XT4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sec16bQ91XT4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec16bQ91XT4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec16bQ91XT4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec16bQ91XT4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec16bQ91XT4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec16bQ91XT4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec16bQ91XT4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec16bQ91XT4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec16bQ91XT4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec16bQ91XT4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec16bQ91XT4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sec16bQ91XT4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sec16bQ91XT4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sec16bQ91XT4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sec16bQ91XT4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sec16bQ91XT4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sec16bQ91XT4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sec16bQ91XT4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sec16bQ91XT4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sec16bQ91XT4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec16bQ91XT4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec16bQ91XT4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec16bQ91XT4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sec16bQ91XT4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sec16bQ91XT4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sec16bQ91XT4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sec16bQ91XT4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sec16bQ91XT4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sec16bQ91XT4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sec16bQ91XT4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sec16bQ91XT4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sec16bQ91XT4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sec16bQ91XT4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sec16bQ91XT4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sec16bQ91XT4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sec16bQ91XT4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sec16bQ91XT4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec16bQ91XT4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec16bQ91XT4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec16bQ91XT4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec16bQ91XT4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec16bQ91XT4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec16bQ91XT4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec16bQ91XT4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec16bQ91XT4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec16bQ91XT4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec16bQ91XT4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec16bQ91XT4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms