Protein–RNA interactions for Protein: Q91WJ8

Fubp1, Far upstream element-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fubp1Q91WJ8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Fubp1Q91WJ8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fubp1Q91WJ8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fubp1Q91WJ8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fubp1Q91WJ8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fubp1Q91WJ8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fubp1Q91WJ8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fubp1Q91WJ8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fubp1Q91WJ8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fubp1Q91WJ8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fubp1Q91WJ8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fubp1Q91WJ8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fubp1Q91WJ8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fubp1Q91WJ8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fubp1Q91WJ8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fubp1Q91WJ8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fubp1Q91WJ8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fubp1Q91WJ8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fubp1Q91WJ8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fubp1Q91WJ8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fubp1Q91WJ8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fubp1Q91WJ8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fubp1Q91WJ8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fubp1Q91WJ8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Fubp1Q91WJ8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fubp1Q91WJ8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fubp1Q91WJ8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fubp1Q91WJ8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fubp1Q91WJ8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fubp1Q91WJ8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fubp1Q91WJ8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fubp1Q91WJ8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fubp1Q91WJ8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fubp1Q91WJ8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fubp1Q91WJ8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fubp1Q91WJ8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fubp1Q91WJ8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fubp1Q91WJ8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fubp1Q91WJ8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fubp1Q91WJ8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Fubp1Q91WJ8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Fubp1Q91WJ8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fubp1Q91WJ8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fubp1Q91WJ8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fubp1Q91WJ8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fubp1Q91WJ8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fubp1Q91WJ8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fubp1Q91WJ8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fubp1Q91WJ8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Fubp1Q91WJ8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Fubp1Q91WJ8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Fubp1Q91WJ8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Fubp1Q91WJ8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fubp1Q91WJ8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fubp1Q91WJ8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fubp1Q91WJ8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fubp1Q91WJ8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Fubp1Q91WJ8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Fubp1Q91WJ8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Fubp1Q91WJ8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fubp1Q91WJ8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fubp1Q91WJ8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Fubp1Q91WJ8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Fubp1Q91WJ8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Fubp1Q91WJ8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Fubp1Q91WJ8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Fubp1Q91WJ8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Fubp1Q91WJ8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Fubp1Q91WJ8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Fubp1Q91WJ8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Fubp1Q91WJ8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Fubp1Q91WJ8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Fubp1Q91WJ8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Fubp1Q91WJ8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Fubp1Q91WJ8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Fubp1Q91WJ8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Fubp1Q91WJ8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Fubp1Q91WJ8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Fubp1Q91WJ8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Fubp1Q91WJ8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Fubp1Q91WJ8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Fubp1Q91WJ8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Fubp1Q91WJ8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Fubp1Q91WJ8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Fubp1Q91WJ8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Fubp1Q91WJ8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Fubp1Q91WJ8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Fubp1Q91WJ8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Fubp1Q91WJ8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fubp1Q91WJ8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fubp1Q91WJ8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fubp1Q91WJ8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fubp1Q91WJ8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fubp1Q91WJ8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Fubp1Q91WJ8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fubp1Q91WJ8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fubp1Q91WJ8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fubp1Q91WJ8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fubp1Q91WJ8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fubp1Q91WJ8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms