Protein–RNA interactions for Protein: Q91W27

Pth2, Tuberoinfundibular peptide of 39 residues, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pth2Q91W27 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pth2Q91W27 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pth2Q91W27 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pth2Q91W27 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pth2Q91W27 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pth2Q91W27 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pth2Q91W27 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pth2Q91W27 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pth2Q91W27 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pth2Q91W27 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pth2Q91W27 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pth2Q91W27 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pth2Q91W27 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pth2Q91W27 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pth2Q91W27 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pth2Q91W27 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pth2Q91W27 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pth2Q91W27 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pth2Q91W27 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pth2Q91W27 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pth2Q91W27 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pth2Q91W27 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pth2Q91W27 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pth2Q91W27 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pth2Q91W27 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pth2Q91W27 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pth2Q91W27 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pth2Q91W27 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pth2Q91W27 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pth2Q91W27 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pth2Q91W27 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pth2Q91W27 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pth2Q91W27 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pth2Q91W27 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pth2Q91W27 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pth2Q91W27 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pth2Q91W27 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pth2Q91W27 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pth2Q91W27 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pth2Q91W27 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pth2Q91W27 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pth2Q91W27 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pth2Q91W27 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pth2Q91W27 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pth2Q91W27 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pth2Q91W27 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pth2Q91W27 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pth2Q91W27 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pth2Q91W27 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pth2Q91W27 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pth2Q91W27 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pth2Q91W27 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pth2Q91W27 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pth2Q91W27 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pth2Q91W27 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pth2Q91W27 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pth2Q91W27 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pth2Q91W27 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pth2Q91W27 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pth2Q91W27 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pth2Q91W27 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pth2Q91W27 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pth2Q91W27 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pth2Q91W27 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pth2Q91W27 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pth2Q91W27 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pth2Q91W27 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pth2Q91W27 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pth2Q91W27 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pth2Q91W27 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pth2Q91W27 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pth2Q91W27 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pth2Q91W27 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pth2Q91W27 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pth2Q91W27 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pth2Q91W27 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pth2Q91W27 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pth2Q91W27 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pth2Q91W27 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pth2Q91W27 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pth2Q91W27 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pth2Q91W27 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pth2Q91W27 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pth2Q91W27 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pth2Q91W27 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pth2Q91W27 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pth2Q91W27 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pth2Q91W27 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pth2Q91W27 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pth2Q91W27 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pth2Q91W27 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pth2Q91W27 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pth2Q91W27 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pth2Q91W27 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pth2Q91W27 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pth2Q91W27 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pth2Q91W27 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pth2Q91W27 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pth2Q91W27 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pth2Q91W27 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms