Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXH2

JPH3, Junctophilin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JPH3Q8WXH2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
JPH3Q8WXH2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
JPH3Q8WXH2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
JPH3Q8WXH2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
JPH3Q8WXH2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
JPH3Q8WXH2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
JPH3Q8WXH2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
JPH3Q8WXH2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
JPH3Q8WXH2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
JPH3Q8WXH2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
JPH3Q8WXH2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
JPH3Q8WXH2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
JPH3Q8WXH2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
JPH3Q8WXH2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
JPH3Q8WXH2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
JPH3Q8WXH2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
JPH3Q8WXH2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
JPH3Q8WXH2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
JPH3Q8WXH2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
JPH3Q8WXH2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
JPH3Q8WXH2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
JPH3Q8WXH2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
JPH3Q8WXH2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
JPH3Q8WXH2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
JPH3Q8WXH2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
JPH3Q8WXH2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
JPH3Q8WXH2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
JPH3Q8WXH2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
JPH3Q8WXH2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
JPH3Q8WXH2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
JPH3Q8WXH2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
JPH3Q8WXH2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
JPH3Q8WXH2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
JPH3Q8WXH2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
JPH3Q8WXH2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
JPH3Q8WXH2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
JPH3Q8WXH2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
JPH3Q8WXH2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
JPH3Q8WXH2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
JPH3Q8WXH2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
JPH3Q8WXH2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
JPH3Q8WXH2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
JPH3Q8WXH2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
JPH3Q8WXH2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
JPH3Q8WXH2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
JPH3Q8WXH2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
JPH3Q8WXH2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
JPH3Q8WXH2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
JPH3Q8WXH2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
JPH3Q8WXH2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
JPH3Q8WXH2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
JPH3Q8WXH2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
JPH3Q8WXH2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
JPH3Q8WXH2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
JPH3Q8WXH2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
JPH3Q8WXH2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
JPH3Q8WXH2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
JPH3Q8WXH2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
JPH3Q8WXH2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
JPH3Q8WXH2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
JPH3Q8WXH2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
JPH3Q8WXH2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
JPH3Q8WXH2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
JPH3Q8WXH2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
JPH3Q8WXH2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
JPH3Q8WXH2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
JPH3Q8WXH2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
JPH3Q8WXH2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
JPH3Q8WXH2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
JPH3Q8WXH2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
JPH3Q8WXH2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
JPH3Q8WXH2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
JPH3Q8WXH2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
JPH3Q8WXH2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
JPH3Q8WXH2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
JPH3Q8WXH2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
JPH3Q8WXH2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
JPH3Q8WXH2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
JPH3Q8WXH2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
JPH3Q8WXH2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
JPH3Q8WXH2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
JPH3Q8WXH2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
JPH3Q8WXH2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
JPH3Q8WXH2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
JPH3Q8WXH2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
JPH3Q8WXH2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
JPH3Q8WXH2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
JPH3Q8WXH2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
JPH3Q8WXH2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
JPH3Q8WXH2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
JPH3Q8WXH2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
JPH3Q8WXH2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
JPH3Q8WXH2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
JPH3Q8WXH2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
JPH3Q8WXH2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
JPH3Q8WXH2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
JPH3Q8WXH2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
JPH3Q8WXH2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
JPH3Q8WXH2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
JPH3Q8WXH2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms