Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC3

PYDC1, Pyrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYDC1Q8WXC3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PYDC1Q8WXC3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PYDC1Q8WXC3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PYDC1Q8WXC3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PYDC1Q8WXC3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PYDC1Q8WXC3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PYDC1Q8WXC3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PYDC1Q8WXC3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PYDC1Q8WXC3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PYDC1Q8WXC3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PYDC1Q8WXC3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PYDC1Q8WXC3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PYDC1Q8WXC3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PYDC1Q8WXC3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PYDC1Q8WXC3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PYDC1Q8WXC3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PYDC1Q8WXC3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PYDC1Q8WXC3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PYDC1Q8WXC3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PYDC1Q8WXC3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PYDC1Q8WXC3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PYDC1Q8WXC3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PYDC1Q8WXC3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PYDC1Q8WXC3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PYDC1Q8WXC3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PYDC1Q8WXC3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PYDC1Q8WXC3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PYDC1Q8WXC3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PYDC1Q8WXC3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PYDC1Q8WXC3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PYDC1Q8WXC3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PYDC1Q8WXC3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PYDC1Q8WXC3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PYDC1Q8WXC3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PYDC1Q8WXC3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PYDC1Q8WXC3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PYDC1Q8WXC3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PYDC1Q8WXC3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PYDC1Q8WXC3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PYDC1Q8WXC3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PYDC1Q8WXC3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PYDC1Q8WXC3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PYDC1Q8WXC3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PYDC1Q8WXC3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PYDC1Q8WXC3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PYDC1Q8WXC3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PYDC1Q8WXC3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PYDC1Q8WXC3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PYDC1Q8WXC3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PYDC1Q8WXC3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PYDC1Q8WXC3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PYDC1Q8WXC3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PYDC1Q8WXC3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PYDC1Q8WXC3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PYDC1Q8WXC3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PYDC1Q8WXC3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PYDC1Q8WXC3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PYDC1Q8WXC3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PYDC1Q8WXC3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PYDC1Q8WXC3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PYDC1Q8WXC3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PYDC1Q8WXC3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PYDC1Q8WXC3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PYDC1Q8WXC3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PYDC1Q8WXC3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PYDC1Q8WXC3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PYDC1Q8WXC3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PYDC1Q8WXC3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PYDC1Q8WXC3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PYDC1Q8WXC3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PYDC1Q8WXC3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PYDC1Q8WXC3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PYDC1Q8WXC3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PYDC1Q8WXC3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PYDC1Q8WXC3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PYDC1Q8WXC3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PYDC1Q8WXC3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PYDC1Q8WXC3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PYDC1Q8WXC3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PYDC1Q8WXC3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PYDC1Q8WXC3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PYDC1Q8WXC3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PYDC1Q8WXC3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PYDC1Q8WXC3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PYDC1Q8WXC3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PYDC1Q8WXC3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PYDC1Q8WXC3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PYDC1Q8WXC3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PYDC1Q8WXC3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PYDC1Q8WXC3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PYDC1Q8WXC3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PYDC1Q8WXC3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PYDC1Q8WXC3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PYDC1Q8WXC3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PYDC1Q8WXC3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PYDC1Q8WXC3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PYDC1Q8WXC3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PYDC1Q8WXC3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PYDC1Q8WXC3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PYDC1Q8WXC3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms