Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW43

APH1B, Gamma-secretase subunit APH-1B, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1BQ8WW43 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APH1BQ8WW43 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APH1BQ8WW43 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APH1BQ8WW43 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APH1BQ8WW43 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APH1BQ8WW43 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APH1BQ8WW43 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APH1BQ8WW43 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APH1BQ8WW43 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APH1BQ8WW43 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APH1BQ8WW43 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APH1BQ8WW43 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APH1BQ8WW43 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APH1BQ8WW43 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APH1BQ8WW43 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APH1BQ8WW43 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APH1BQ8WW43 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APH1BQ8WW43 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
APH1BQ8WW43 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APH1BQ8WW43 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APH1BQ8WW43 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APH1BQ8WW43 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APH1BQ8WW43 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APH1BQ8WW43 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APH1BQ8WW43 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APH1BQ8WW43 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APH1BQ8WW43 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APH1BQ8WW43 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APH1BQ8WW43 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APH1BQ8WW43 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APH1BQ8WW43 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APH1BQ8WW43 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APH1BQ8WW43 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APH1BQ8WW43 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APH1BQ8WW43 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APH1BQ8WW43 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APH1BQ8WW43 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APH1BQ8WW43 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APH1BQ8WW43 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APH1BQ8WW43 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APH1BQ8WW43 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APH1BQ8WW43 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APH1BQ8WW43 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
APH1BQ8WW43 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APH1BQ8WW43 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APH1BQ8WW43 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APH1BQ8WW43 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APH1BQ8WW43 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APH1BQ8WW43 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APH1BQ8WW43 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APH1BQ8WW43 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
APH1BQ8WW43 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APH1BQ8WW43 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APH1BQ8WW43 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APH1BQ8WW43 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APH1BQ8WW43 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APH1BQ8WW43 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APH1BQ8WW43 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
APH1BQ8WW43 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
APH1BQ8WW43 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APH1BQ8WW43 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APH1BQ8WW43 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APH1BQ8WW43 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APH1BQ8WW43 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APH1BQ8WW43 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APH1BQ8WW43 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APH1BQ8WW43 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APH1BQ8WW43 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APH1BQ8WW43 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APH1BQ8WW43 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
APH1BQ8WW43 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APH1BQ8WW43 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APH1BQ8WW43 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APH1BQ8WW43 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APH1BQ8WW43 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APH1BQ8WW43 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APH1BQ8WW43 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
APH1BQ8WW43 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APH1BQ8WW43 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APH1BQ8WW43 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
APH1BQ8WW43 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APH1BQ8WW43 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APH1BQ8WW43 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APH1BQ8WW43 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APH1BQ8WW43 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APH1BQ8WW43 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APH1BQ8WW43 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APH1BQ8WW43 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APH1BQ8WW43 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APH1BQ8WW43 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APH1BQ8WW43 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APH1BQ8WW43 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APH1BQ8WW43 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APH1BQ8WW43 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APH1BQ8WW43 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APH1BQ8WW43 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APH1BQ8WW43 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APH1BQ8WW43 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APH1BQ8WW43 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APH1BQ8WW43 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms