Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIJ6

Sfpq, Splicing factor, proline- and glutamine-rich, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfpqQ8VIJ6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SfpqQ8VIJ6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SfpqQ8VIJ6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SfpqQ8VIJ6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SfpqQ8VIJ6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SfpqQ8VIJ6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SfpqQ8VIJ6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SfpqQ8VIJ6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SfpqQ8VIJ6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SfpqQ8VIJ6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SfpqQ8VIJ6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SfpqQ8VIJ6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SfpqQ8VIJ6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SfpqQ8VIJ6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SfpqQ8VIJ6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SfpqQ8VIJ6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SfpqQ8VIJ6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SfpqQ8VIJ6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SfpqQ8VIJ6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SfpqQ8VIJ6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SfpqQ8VIJ6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SfpqQ8VIJ6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SfpqQ8VIJ6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SfpqQ8VIJ6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SfpqQ8VIJ6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SfpqQ8VIJ6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SfpqQ8VIJ6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SfpqQ8VIJ6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SfpqQ8VIJ6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SfpqQ8VIJ6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SfpqQ8VIJ6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SfpqQ8VIJ6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SfpqQ8VIJ6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SfpqQ8VIJ6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SfpqQ8VIJ6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SfpqQ8VIJ6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SfpqQ8VIJ6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SfpqQ8VIJ6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SfpqQ8VIJ6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SfpqQ8VIJ6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SfpqQ8VIJ6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SfpqQ8VIJ6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SfpqQ8VIJ6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SfpqQ8VIJ6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SfpqQ8VIJ6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SfpqQ8VIJ6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SfpqQ8VIJ6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SfpqQ8VIJ6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SfpqQ8VIJ6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SfpqQ8VIJ6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SfpqQ8VIJ6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SfpqQ8VIJ6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SfpqQ8VIJ6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SfpqQ8VIJ6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SfpqQ8VIJ6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SfpqQ8VIJ6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SfpqQ8VIJ6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SfpqQ8VIJ6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SfpqQ8VIJ6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SfpqQ8VIJ6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SfpqQ8VIJ6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SfpqQ8VIJ6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SfpqQ8VIJ6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SfpqQ8VIJ6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SfpqQ8VIJ6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SfpqQ8VIJ6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SfpqQ8VIJ6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SfpqQ8VIJ6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SfpqQ8VIJ6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SfpqQ8VIJ6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SfpqQ8VIJ6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SfpqQ8VIJ6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SfpqQ8VIJ6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SfpqQ8VIJ6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SfpqQ8VIJ6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SfpqQ8VIJ6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SfpqQ8VIJ6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SfpqQ8VIJ6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SfpqQ8VIJ6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SfpqQ8VIJ6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SfpqQ8VIJ6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SfpqQ8VIJ6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SfpqQ8VIJ6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SfpqQ8VIJ6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SfpqQ8VIJ6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SfpqQ8VIJ6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SfpqQ8VIJ6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SfpqQ8VIJ6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SfpqQ8VIJ6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SfpqQ8VIJ6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SfpqQ8VIJ6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SfpqQ8VIJ6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SfpqQ8VIJ6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SfpqQ8VIJ6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SfpqQ8VIJ6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SfpqQ8VIJ6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SfpqQ8VIJ6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SfpqQ8VIJ6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SfpqQ8VIJ6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SfpqQ8VIJ6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms