Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vps4aQ8VEJ9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps4aQ8VEJ9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps4aQ8VEJ9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps4aQ8VEJ9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps4aQ8VEJ9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps4aQ8VEJ9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps4aQ8VEJ9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps4aQ8VEJ9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps4aQ8VEJ9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps4aQ8VEJ9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps4aQ8VEJ9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps4aQ8VEJ9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps4aQ8VEJ9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps4aQ8VEJ9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps4aQ8VEJ9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps4aQ8VEJ9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps4aQ8VEJ9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps4aQ8VEJ9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps4aQ8VEJ9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps4aQ8VEJ9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps4aQ8VEJ9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps4aQ8VEJ9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps4aQ8VEJ9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps4aQ8VEJ9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps4aQ8VEJ9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps4aQ8VEJ9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps4aQ8VEJ9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps4aQ8VEJ9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps4aQ8VEJ9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps4aQ8VEJ9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps4aQ8VEJ9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps4aQ8VEJ9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps4aQ8VEJ9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps4aQ8VEJ9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps4aQ8VEJ9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps4aQ8VEJ9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps4aQ8VEJ9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps4aQ8VEJ9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps4aQ8VEJ9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps4aQ8VEJ9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps4aQ8VEJ9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps4aQ8VEJ9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps4aQ8VEJ9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps4aQ8VEJ9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps4aQ8VEJ9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps4aQ8VEJ9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps4aQ8VEJ9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps4aQ8VEJ9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps4aQ8VEJ9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps4aQ8VEJ9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps4aQ8VEJ9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps4aQ8VEJ9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps4aQ8VEJ9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps4aQ8VEJ9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps4aQ8VEJ9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps4aQ8VEJ9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps4aQ8VEJ9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps4aQ8VEJ9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps4aQ8VEJ9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps4aQ8VEJ9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps4aQ8VEJ9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps4aQ8VEJ9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps4aQ8VEJ9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps4aQ8VEJ9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps4aQ8VEJ9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps4aQ8VEJ9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps4aQ8VEJ9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps4aQ8VEJ9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps4aQ8VEJ9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps4aQ8VEJ9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vps4aQ8VEJ9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vps4aQ8VEJ9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps4aQ8VEJ9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps4aQ8VEJ9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps4aQ8VEJ9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps4aQ8VEJ9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps4aQ8VEJ9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps4aQ8VEJ9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps4aQ8VEJ9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps4aQ8VEJ9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps4aQ8VEJ9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps4aQ8VEJ9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps4aQ8VEJ9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps4aQ8VEJ9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps4aQ8VEJ9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps4aQ8VEJ9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps4aQ8VEJ9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps4aQ8VEJ9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps4aQ8VEJ9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps4aQ8VEJ9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps4aQ8VEJ9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps4aQ8VEJ9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps4aQ8VEJ9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vps4aQ8VEJ9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vps4aQ8VEJ9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps4aQ8VEJ9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps4aQ8VEJ9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps4aQ8VEJ9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps4aQ8VEJ9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.3 ms