Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dnajc28Q8VCE1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dnajc28Q8VCE1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dnajc28Q8VCE1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dnajc28Q8VCE1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dnajc28Q8VCE1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dnajc28Q8VCE1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dnajc28Q8VCE1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dnajc28Q8VCE1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dnajc28Q8VCE1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dnajc28Q8VCE1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dnajc28Q8VCE1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Dnajc28Q8VCE1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Dnajc28Q8VCE1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Dnajc28Q8VCE1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Dnajc28Q8VCE1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Dnajc28Q8VCE1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Dnajc28Q8VCE1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Dnajc28Q8VCE1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dnajc28Q8VCE1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dnajc28Q8VCE1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dnajc28Q8VCE1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dnajc28Q8VCE1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dnajc28Q8VCE1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dnajc28Q8VCE1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dnajc28Q8VCE1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dnajc28Q8VCE1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dnajc28Q8VCE1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Dnajc28Q8VCE1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dnajc28Q8VCE1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dnajc28Q8VCE1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dnajc28Q8VCE1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dnajc28Q8VCE1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dnajc28Q8VCE1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dnajc28Q8VCE1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dnajc28Q8VCE1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dnajc28Q8VCE1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dnajc28Q8VCE1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dnajc28Q8VCE1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dnajc28Q8VCE1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dnajc28Q8VCE1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dnajc28Q8VCE1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dnajc28Q8VCE1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dnajc28Q8VCE1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dnajc28Q8VCE1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dnajc28Q8VCE1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dnajc28Q8VCE1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dnajc28Q8VCE1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Dnajc28Q8VCE1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dnajc28Q8VCE1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dnajc28Q8VCE1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dnajc28Q8VCE1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dnajc28Q8VCE1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dnajc28Q8VCE1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dnajc28Q8VCE1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dnajc28Q8VCE1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dnajc28Q8VCE1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dnajc28Q8VCE1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dnajc28Q8VCE1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dnajc28Q8VCE1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dnajc28Q8VCE1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dnajc28Q8VCE1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dnajc28Q8VCE1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Dnajc28Q8VCE1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dnajc28Q8VCE1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dnajc28Q8VCE1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dnajc28Q8VCE1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dnajc28Q8VCE1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dnajc28Q8VCE1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dnajc28Q8VCE1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dnajc28Q8VCE1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dnajc28Q8VCE1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dnajc28Q8VCE1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dnajc28Q8VCE1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Dnajc28Q8VCE1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dnajc28Q8VCE1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dnajc28Q8VCE1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dnajc28Q8VCE1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dnajc28Q8VCE1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dnajc28Q8VCE1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Dnajc28Q8VCE1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dnajc28Q8VCE1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Dnajc28Q8VCE1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dnajc28Q8VCE1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dnajc28Q8VCE1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dnajc28Q8VCE1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dnajc28Q8VCE1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dnajc28Q8VCE1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dnajc28Q8VCE1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dnajc28Q8VCE1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dnajc28Q8VCE1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dnajc28Q8VCE1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dnajc28Q8VCE1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dnajc28Q8VCE1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dnajc28Q8VCE1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Dnajc28Q8VCE1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dnajc28Q8VCE1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dnajc28Q8VCE1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dnajc28Q8VCE1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dnajc28Q8VCE1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms