Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD7

Kdm4c, Lysine-specific demethylase 4C, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4cQ8VCD7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm4cQ8VCD7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm4cQ8VCD7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm4cQ8VCD7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm4cQ8VCD7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm4cQ8VCD7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm4cQ8VCD7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm4cQ8VCD7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm4cQ8VCD7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm4cQ8VCD7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm4cQ8VCD7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm4cQ8VCD7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm4cQ8VCD7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm4cQ8VCD7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm4cQ8VCD7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm4cQ8VCD7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm4cQ8VCD7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm4cQ8VCD7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm4cQ8VCD7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm4cQ8VCD7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm4cQ8VCD7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm4cQ8VCD7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm4cQ8VCD7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm4cQ8VCD7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm4cQ8VCD7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm4cQ8VCD7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm4cQ8VCD7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm4cQ8VCD7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm4cQ8VCD7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm4cQ8VCD7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Kdm4cQ8VCD7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kdm4cQ8VCD7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kdm4cQ8VCD7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Kdm4cQ8VCD7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kdm4cQ8VCD7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm4cQ8VCD7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm4cQ8VCD7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm4cQ8VCD7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm4cQ8VCD7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm4cQ8VCD7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kdm4cQ8VCD7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kdm4cQ8VCD7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kdm4cQ8VCD7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kdm4cQ8VCD7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kdm4cQ8VCD7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kdm4cQ8VCD7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kdm4cQ8VCD7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kdm4cQ8VCD7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kdm4cQ8VCD7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kdm4cQ8VCD7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kdm4cQ8VCD7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Kdm4cQ8VCD7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kdm4cQ8VCD7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kdm4cQ8VCD7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kdm4cQ8VCD7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kdm4cQ8VCD7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kdm4cQ8VCD7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kdm4cQ8VCD7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Kdm4cQ8VCD7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Kdm4cQ8VCD7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm4cQ8VCD7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm4cQ8VCD7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm4cQ8VCD7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kdm4cQ8VCD7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kdm4cQ8VCD7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kdm4cQ8VCD7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kdm4cQ8VCD7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kdm4cQ8VCD7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Kdm4cQ8VCD7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm4cQ8VCD7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kdm4cQ8VCD7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Kdm4cQ8VCD7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Kdm4cQ8VCD7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Kdm4cQ8VCD7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kdm4cQ8VCD7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kdm4cQ8VCD7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kdm4cQ8VCD7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kdm4cQ8VCD7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Kdm4cQ8VCD7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kdm4cQ8VCD7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kdm4cQ8VCD7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kdm4cQ8VCD7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kdm4cQ8VCD7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kdm4cQ8VCD7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kdm4cQ8VCD7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kdm4cQ8VCD7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kdm4cQ8VCD7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kdm4cQ8VCD7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kdm4cQ8VCD7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Kdm4cQ8VCD7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Kdm4cQ8VCD7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kdm4cQ8VCD7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kdm4cQ8VCD7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Kdm4cQ8VCD7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm4cQ8VCD7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm4cQ8VCD7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm4cQ8VCD7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm4cQ8VCD7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm4cQ8VCD7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm4cQ8VCD7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms