Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW6

Nae1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nae1Q8VBW6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nae1Q8VBW6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nae1Q8VBW6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nae1Q8VBW6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nae1Q8VBW6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nae1Q8VBW6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nae1Q8VBW6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nae1Q8VBW6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nae1Q8VBW6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nae1Q8VBW6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nae1Q8VBW6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nae1Q8VBW6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nae1Q8VBW6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nae1Q8VBW6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nae1Q8VBW6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nae1Q8VBW6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nae1Q8VBW6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nae1Q8VBW6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nae1Q8VBW6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nae1Q8VBW6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nae1Q8VBW6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nae1Q8VBW6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nae1Q8VBW6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nae1Q8VBW6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nae1Q8VBW6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nae1Q8VBW6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nae1Q8VBW6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nae1Q8VBW6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nae1Q8VBW6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nae1Q8VBW6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nae1Q8VBW6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nae1Q8VBW6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nae1Q8VBW6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nae1Q8VBW6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nae1Q8VBW6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nae1Q8VBW6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nae1Q8VBW6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nae1Q8VBW6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nae1Q8VBW6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nae1Q8VBW6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nae1Q8VBW6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nae1Q8VBW6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nae1Q8VBW6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nae1Q8VBW6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nae1Q8VBW6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nae1Q8VBW6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nae1Q8VBW6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nae1Q8VBW6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Nae1Q8VBW6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nae1Q8VBW6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Nae1Q8VBW6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nae1Q8VBW6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nae1Q8VBW6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nae1Q8VBW6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nae1Q8VBW6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nae1Q8VBW6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nae1Q8VBW6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nae1Q8VBW6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nae1Q8VBW6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Nae1Q8VBW6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Nae1Q8VBW6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nae1Q8VBW6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nae1Q8VBW6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nae1Q8VBW6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nae1Q8VBW6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nae1Q8VBW6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nae1Q8VBW6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nae1Q8VBW6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nae1Q8VBW6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nae1Q8VBW6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nae1Q8VBW6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nae1Q8VBW6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Nae1Q8VBW6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nae1Q8VBW6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nae1Q8VBW6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nae1Q8VBW6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nae1Q8VBW6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nae1Q8VBW6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nae1Q8VBW6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nae1Q8VBW6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nae1Q8VBW6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Nae1Q8VBW6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nae1Q8VBW6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nae1Q8VBW6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nae1Q8VBW6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nae1Q8VBW6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nae1Q8VBW6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nae1Q8VBW6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nae1Q8VBW6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nae1Q8VBW6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nae1Q8VBW6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nae1Q8VBW6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nae1Q8VBW6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nae1Q8VBW6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nae1Q8VBW6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nae1Q8VBW6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nae1Q8VBW6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nae1Q8VBW6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nae1Q8VBW6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nae1Q8VBW6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms