Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY3

ACTRT2, Actin-related protein T2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT2Q8TDY3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACTRT2Q8TDY3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACTRT2Q8TDY3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACTRT2Q8TDY3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACTRT2Q8TDY3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTRT2Q8TDY3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTRT2Q8TDY3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTRT2Q8TDY3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTRT2Q8TDY3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTRT2Q8TDY3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTRT2Q8TDY3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTRT2Q8TDY3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTRT2Q8TDY3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTRT2Q8TDY3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTRT2Q8TDY3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTRT2Q8TDY3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTRT2Q8TDY3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTRT2Q8TDY3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTRT2Q8TDY3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTRT2Q8TDY3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTRT2Q8TDY3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTRT2Q8TDY3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTRT2Q8TDY3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTRT2Q8TDY3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACTRT2Q8TDY3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACTRT2Q8TDY3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACTRT2Q8TDY3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACTRT2Q8TDY3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ACTRT2Q8TDY3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACTRT2Q8TDY3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACTRT2Q8TDY3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACTRT2Q8TDY3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTRT2Q8TDY3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTRT2Q8TDY3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTRT2Q8TDY3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTRT2Q8TDY3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTRT2Q8TDY3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTRT2Q8TDY3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTRT2Q8TDY3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTRT2Q8TDY3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTRT2Q8TDY3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTRT2Q8TDY3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTRT2Q8TDY3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTRT2Q8TDY3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTRT2Q8TDY3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTRT2Q8TDY3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTRT2Q8TDY3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTRT2Q8TDY3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTRT2Q8TDY3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTRT2Q8TDY3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTRT2Q8TDY3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTRT2Q8TDY3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTRT2Q8TDY3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTRT2Q8TDY3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTRT2Q8TDY3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTRT2Q8TDY3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTRT2Q8TDY3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTRT2Q8TDY3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTRT2Q8TDY3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTRT2Q8TDY3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTRT2Q8TDY3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTRT2Q8TDY3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTRT2Q8TDY3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTRT2Q8TDY3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTRT2Q8TDY3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTRT2Q8TDY3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTRT2Q8TDY3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTRT2Q8TDY3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTRT2Q8TDY3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTRT2Q8TDY3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTRT2Q8TDY3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTRT2Q8TDY3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTRT2Q8TDY3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTRT2Q8TDY3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTRT2Q8TDY3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTRT2Q8TDY3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTRT2Q8TDY3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTRT2Q8TDY3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTRT2Q8TDY3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTRT2Q8TDY3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTRT2Q8TDY3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTRT2Q8TDY3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTRT2Q8TDY3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTRT2Q8TDY3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTRT2Q8TDY3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTRT2Q8TDY3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTRT2Q8TDY3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTRT2Q8TDY3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTRT2Q8TDY3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTRT2Q8TDY3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTRT2Q8TDY3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTRT2Q8TDY3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTRT2Q8TDY3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTRT2Q8TDY3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTRT2Q8TDY3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTRT2Q8TDY3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTRT2Q8TDY3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTRT2Q8TDY3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTRT2Q8TDY3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTRT2Q8TDY3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms