Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD06

AGR3, Anterior gradient protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGR3Q8TD06 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
AGR3Q8TD06 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
AGR3Q8TD06 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
AGR3Q8TD06 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AGR3Q8TD06 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AGR3Q8TD06 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AGR3Q8TD06 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AGR3Q8TD06 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AGR3Q8TD06 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AGR3Q8TD06 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AGR3Q8TD06 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AGR3Q8TD06 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AGR3Q8TD06 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AGR3Q8TD06 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AGR3Q8TD06 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AGR3Q8TD06 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AGR3Q8TD06 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
AGR3Q8TD06 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AGR3Q8TD06 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AGR3Q8TD06 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AGR3Q8TD06 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AGR3Q8TD06 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AGR3Q8TD06 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGR3Q8TD06 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGR3Q8TD06 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGR3Q8TD06 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AGR3Q8TD06 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AGR3Q8TD06 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AGR3Q8TD06 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AGR3Q8TD06 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AGR3Q8TD06 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AGR3Q8TD06 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AGR3Q8TD06 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AGR3Q8TD06 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AGR3Q8TD06 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AGR3Q8TD06 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AGR3Q8TD06 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AGR3Q8TD06 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
AGR3Q8TD06 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AGR3Q8TD06 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AGR3Q8TD06 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AGR3Q8TD06 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AGR3Q8TD06 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AGR3Q8TD06 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AGR3Q8TD06 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AGR3Q8TD06 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
AGR3Q8TD06 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AGR3Q8TD06 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AGR3Q8TD06 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AGR3Q8TD06 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AGR3Q8TD06 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AGR3Q8TD06 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25■■□□□ 1.59
AGR3Q8TD06 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AGR3Q8TD06 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AGR3Q8TD06 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AGR3Q8TD06 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AGR3Q8TD06 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AGR3Q8TD06 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AGR3Q8TD06 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AGR3Q8TD06 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
AGR3Q8TD06 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGR3Q8TD06 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGR3Q8TD06 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGR3Q8TD06 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGR3Q8TD06 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGR3Q8TD06 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGR3Q8TD06 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGR3Q8TD06 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGR3Q8TD06 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGR3Q8TD06 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGR3Q8TD06 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGR3Q8TD06 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
AGR3Q8TD06 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGR3Q8TD06 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGR3Q8TD06 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGR3Q8TD06 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGR3Q8TD06 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGR3Q8TD06 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGR3Q8TD06 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGR3Q8TD06 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGR3Q8TD06 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGR3Q8TD06 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGR3Q8TD06 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
AGR3Q8TD06 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGR3Q8TD06 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGR3Q8TD06 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGR3Q8TD06 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGR3Q8TD06 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGR3Q8TD06 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGR3Q8TD06 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGR3Q8TD06 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
AGR3Q8TD06 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGR3Q8TD06 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AGR3Q8TD06 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AGR3Q8TD06 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGR3Q8TD06 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGR3Q8TD06 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGR3Q8TD06 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGR3Q8TD06 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGR3Q8TD06 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms