Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3P9

Slf1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf1Q8R3P9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slf1Q8R3P9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slf1Q8R3P9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slf1Q8R3P9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slf1Q8R3P9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slf1Q8R3P9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slf1Q8R3P9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slf1Q8R3P9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slf1Q8R3P9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slf1Q8R3P9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slf1Q8R3P9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slf1Q8R3P9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slf1Q8R3P9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slf1Q8R3P9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slf1Q8R3P9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slf1Q8R3P9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slf1Q8R3P9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slf1Q8R3P9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slf1Q8R3P9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slf1Q8R3P9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slf1Q8R3P9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slf1Q8R3P9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slf1Q8R3P9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slf1Q8R3P9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slf1Q8R3P9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slf1Q8R3P9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Slf1Q8R3P9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slf1Q8R3P9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slf1Q8R3P9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slf1Q8R3P9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slf1Q8R3P9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slf1Q8R3P9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slf1Q8R3P9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slf1Q8R3P9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slf1Q8R3P9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slf1Q8R3P9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slf1Q8R3P9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slf1Q8R3P9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slf1Q8R3P9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slf1Q8R3P9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slf1Q8R3P9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slf1Q8R3P9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slf1Q8R3P9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slf1Q8R3P9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slf1Q8R3P9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slf1Q8R3P9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slf1Q8R3P9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slf1Q8R3P9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slf1Q8R3P9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slf1Q8R3P9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slf1Q8R3P9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slf1Q8R3P9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slf1Q8R3P9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slf1Q8R3P9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slf1Q8R3P9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slf1Q8R3P9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slf1Q8R3P9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slf1Q8R3P9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slf1Q8R3P9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slf1Q8R3P9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slf1Q8R3P9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slf1Q8R3P9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slf1Q8R3P9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slf1Q8R3P9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slf1Q8R3P9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slf1Q8R3P9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slf1Q8R3P9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slf1Q8R3P9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slf1Q8R3P9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slf1Q8R3P9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slf1Q8R3P9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slf1Q8R3P9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slf1Q8R3P9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slf1Q8R3P9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slf1Q8R3P9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slf1Q8R3P9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slf1Q8R3P9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slf1Q8R3P9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slf1Q8R3P9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slf1Q8R3P9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slf1Q8R3P9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slf1Q8R3P9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slf1Q8R3P9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slf1Q8R3P9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slf1Q8R3P9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slf1Q8R3P9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slf1Q8R3P9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slf1Q8R3P9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slf1Q8R3P9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Slf1Q8R3P9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Slf1Q8R3P9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slf1Q8R3P9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slf1Q8R3P9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slf1Q8R3P9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slf1Q8R3P9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slf1Q8R3P9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slf1Q8R3P9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slf1Q8R3P9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slf1Q8R3P9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slf1Q8R3P9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms