Protein–RNA interactions for Protein: Q8R311

Ctage5, Endoplasmic reticulum export factor CTAGE5, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctage5Q8R311 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ctage5Q8R311 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ctage5Q8R311 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ctage5Q8R311 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ctage5Q8R311 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ctage5Q8R311 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ctage5Q8R311 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ctage5Q8R311 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ctage5Q8R311 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ctage5Q8R311 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ctage5Q8R311 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ctage5Q8R311 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ctage5Q8R311 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ctage5Q8R311 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ctage5Q8R311 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctage5Q8R311 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctage5Q8R311 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctage5Q8R311 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ctage5Q8R311 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ctage5Q8R311 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ctage5Q8R311 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ctage5Q8R311 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ctage5Q8R311 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ctage5Q8R311 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ctage5Q8R311 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ctage5Q8R311 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ctage5Q8R311 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ctage5Q8R311 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ctage5Q8R311 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ctage5Q8R311 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ctage5Q8R311 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ctage5Q8R311 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ctage5Q8R311 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ctage5Q8R311 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ctage5Q8R311 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ctage5Q8R311 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ctage5Q8R311 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ctage5Q8R311 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ctage5Q8R311 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ctage5Q8R311 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ctage5Q8R311 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ctage5Q8R311 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ctage5Q8R311 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ctage5Q8R311 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ctage5Q8R311 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ctage5Q8R311 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ctage5Q8R311 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ctage5Q8R311 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ctage5Q8R311 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ctage5Q8R311 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ctage5Q8R311 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ctage5Q8R311 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ctage5Q8R311 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ctage5Q8R311 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ctage5Q8R311 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ctage5Q8R311 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ctage5Q8R311 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ctage5Q8R311 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ctage5Q8R311 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctage5Q8R311 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctage5Q8R311 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctage5Q8R311 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctage5Q8R311 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ctage5Q8R311 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ctage5Q8R311 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ctage5Q8R311 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctage5Q8R311 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctage5Q8R311 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctage5Q8R311 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctage5Q8R311 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctage5Q8R311 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctage5Q8R311 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctage5Q8R311 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctage5Q8R311 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ctage5Q8R311 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ctage5Q8R311 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctage5Q8R311 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctage5Q8R311 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ctage5Q8R311 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ctage5Q8R311 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ctage5Q8R311 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ctage5Q8R311 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ctage5Q8R311 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ctage5Q8R311 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ctage5Q8R311 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ctage5Q8R311 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ctage5Q8R311 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ctage5Q8R311 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ctage5Q8R311 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ctage5Q8R311 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ctage5Q8R311 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ctage5Q8R311 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ctage5Q8R311 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ctage5Q8R311 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ctage5Q8R311 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ctage5Q8R311 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ctage5Q8R311 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctage5Q8R311 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctage5Q8R311 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctage5Q8R311 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms