Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0H9

Gga1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga1Q8R0H9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gga1Q8R0H9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gga1Q8R0H9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gga1Q8R0H9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gga1Q8R0H9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gga1Q8R0H9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gga1Q8R0H9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gga1Q8R0H9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gga1Q8R0H9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gga1Q8R0H9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gga1Q8R0H9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gga1Q8R0H9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gga1Q8R0H9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gga1Q8R0H9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gga1Q8R0H9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gga1Q8R0H9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gga1Q8R0H9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gga1Q8R0H9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gga1Q8R0H9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Gga1Q8R0H9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gga1Q8R0H9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gga1Q8R0H9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gga1Q8R0H9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gga1Q8R0H9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gga1Q8R0H9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gga1Q8R0H9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gga1Q8R0H9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gga1Q8R0H9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Gga1Q8R0H9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gga1Q8R0H9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Gga1Q8R0H9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gga1Q8R0H9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gga1Q8R0H9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gga1Q8R0H9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gga1Q8R0H9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gga1Q8R0H9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gga1Q8R0H9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gga1Q8R0H9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gga1Q8R0H9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gga1Q8R0H9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gga1Q8R0H9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gga1Q8R0H9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gga1Q8R0H9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gga1Q8R0H9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gga1Q8R0H9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gga1Q8R0H9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Gga1Q8R0H9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gga1Q8R0H9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gga1Q8R0H9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gga1Q8R0H9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gga1Q8R0H9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gga1Q8R0H9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gga1Q8R0H9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gga1Q8R0H9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gga1Q8R0H9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gga1Q8R0H9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gga1Q8R0H9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gga1Q8R0H9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gga1Q8R0H9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gga1Q8R0H9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gga1Q8R0H9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Gga1Q8R0H9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gga1Q8R0H9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gga1Q8R0H9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gga1Q8R0H9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gga1Q8R0H9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gga1Q8R0H9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gga1Q8R0H9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gga1Q8R0H9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gga1Q8R0H9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gga1Q8R0H9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gga1Q8R0H9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gga1Q8R0H9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gga1Q8R0H9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gga1Q8R0H9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gga1Q8R0H9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gga1Q8R0H9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gga1Q8R0H9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gga1Q8R0H9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gga1Q8R0H9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gga1Q8R0H9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Gga1Q8R0H9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gga1Q8R0H9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gga1Q8R0H9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gga1Q8R0H9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gga1Q8R0H9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gga1Q8R0H9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gga1Q8R0H9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gga1Q8R0H9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gga1Q8R0H9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gga1Q8R0H9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gga1Q8R0H9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gga1Q8R0H9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gga1Q8R0H9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gga1Q8R0H9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gga1Q8R0H9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gga1Q8R0H9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gga1Q8R0H9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Gga1Q8R0H9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Gga1Q8R0H9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.6 ms