Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
COL22A1Q8NFW1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
COL22A1Q8NFW1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
COL22A1Q8NFW1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
COL22A1Q8NFW1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
COL22A1Q8NFW1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
COL22A1Q8NFW1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
COL22A1Q8NFW1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
COL22A1Q8NFW1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
COL22A1Q8NFW1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
COL22A1Q8NFW1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
COL22A1Q8NFW1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC35.38■■■■□ 3.25
COL22A1Q8NFW1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
COL22A1Q8NFW1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
COL22A1Q8NFW1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
COL22A1Q8NFW1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
COL22A1Q8NFW1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
COL22A1Q8NFW1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
COL22A1Q8NFW1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
COL22A1Q8NFW1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
COL22A1Q8NFW1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
COL22A1Q8NFW1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
COL22A1Q8NFW1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
COL22A1Q8NFW1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
COL22A1Q8NFW1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
COL22A1Q8NFW1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
COL22A1Q8NFW1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
COL22A1Q8NFW1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
COL22A1Q8NFW1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
COL22A1Q8NFW1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
COL22A1Q8NFW1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
COL22A1Q8NFW1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
COL22A1Q8NFW1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
COL22A1Q8NFW1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
COL22A1Q8NFW1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
COL22A1Q8NFW1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
COL22A1Q8NFW1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
COL22A1Q8NFW1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
COL22A1Q8NFW1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
COL22A1Q8NFW1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
COL22A1Q8NFW1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
COL22A1Q8NFW1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
COL22A1Q8NFW1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
COL22A1Q8NFW1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
COL22A1Q8NFW1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
COL22A1Q8NFW1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
COL22A1Q8NFW1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
COL22A1Q8NFW1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
COL22A1Q8NFW1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
COL22A1Q8NFW1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
COL22A1Q8NFW1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
COL22A1Q8NFW1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
COL22A1Q8NFW1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
COL22A1Q8NFW1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
COL22A1Q8NFW1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
COL22A1Q8NFW1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
COL22A1Q8NFW1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
COL22A1Q8NFW1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
COL22A1Q8NFW1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
COL22A1Q8NFW1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
COL22A1Q8NFW1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
COL22A1Q8NFW1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
COL22A1Q8NFW1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC35.19■■■■□ 3.22
COL22A1Q8NFW1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
COL22A1Q8NFW1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
COL22A1Q8NFW1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
COL22A1Q8NFW1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
COL22A1Q8NFW1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
COL22A1Q8NFW1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
COL22A1Q8NFW1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
COL22A1Q8NFW1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
COL22A1Q8NFW1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
COL22A1Q8NFW1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC35.16■■■■□ 3.22
COL22A1Q8NFW1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
COL22A1Q8NFW1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
COL22A1Q8NFW1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
COL22A1Q8NFW1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
COL22A1Q8NFW1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
COL22A1Q8NFW1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
COL22A1Q8NFW1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
COL22A1Q8NFW1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
COL22A1Q8NFW1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
COL22A1Q8NFW1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
COL22A1Q8NFW1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
COL22A1Q8NFW1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
COL22A1Q8NFW1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
COL22A1Q8NFW1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
COL22A1Q8NFW1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
COL22A1Q8NFW1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
COL22A1Q8NFW1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
COL22A1Q8NFW1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
COL22A1Q8NFW1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
COL22A1Q8NFW1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
COL22A1Q8NFW1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
COL22A1Q8NFW1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
COL22A1Q8NFW1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
COL22A1Q8NFW1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
COL22A1Q8NFW1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
COL22A1Q8NFW1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
COL22A1Q8NFW1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms