Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BHLHE22Q8NFJ8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BHLHE22Q8NFJ8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BHLHE22Q8NFJ8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BHLHE22Q8NFJ8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BHLHE22Q8NFJ8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
BHLHE22Q8NFJ8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BHLHE22Q8NFJ8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BHLHE22Q8NFJ8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BHLHE22Q8NFJ8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BHLHE22Q8NFJ8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BHLHE22Q8NFJ8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BHLHE22Q8NFJ8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
BHLHE22Q8NFJ8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BHLHE22Q8NFJ8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
BHLHE22Q8NFJ8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BHLHE22Q8NFJ8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BHLHE22Q8NFJ8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BHLHE22Q8NFJ8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BHLHE22Q8NFJ8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BHLHE22Q8NFJ8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BHLHE22Q8NFJ8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BHLHE22Q8NFJ8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BHLHE22Q8NFJ8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BHLHE22Q8NFJ8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BHLHE22Q8NFJ8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BHLHE22Q8NFJ8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BHLHE22Q8NFJ8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BHLHE22Q8NFJ8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BHLHE22Q8NFJ8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BHLHE22Q8NFJ8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BHLHE22Q8NFJ8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BHLHE22Q8NFJ8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BHLHE22Q8NFJ8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BHLHE22Q8NFJ8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BHLHE22Q8NFJ8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BHLHE22Q8NFJ8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BHLHE22Q8NFJ8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BHLHE22Q8NFJ8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BHLHE22Q8NFJ8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BHLHE22Q8NFJ8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BHLHE22Q8NFJ8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BHLHE22Q8NFJ8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BHLHE22Q8NFJ8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BHLHE22Q8NFJ8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BHLHE22Q8NFJ8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BHLHE22Q8NFJ8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BHLHE22Q8NFJ8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BHLHE22Q8NFJ8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BHLHE22Q8NFJ8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BHLHE22Q8NFJ8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
BHLHE22Q8NFJ8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
BHLHE22Q8NFJ8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BHLHE22Q8NFJ8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BHLHE22Q8NFJ8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BHLHE22Q8NFJ8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BHLHE22Q8NFJ8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BHLHE22Q8NFJ8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BHLHE22Q8NFJ8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BHLHE22Q8NFJ8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BHLHE22Q8NFJ8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BHLHE22Q8NFJ8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BHLHE22Q8NFJ8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BHLHE22Q8NFJ8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BHLHE22Q8NFJ8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BHLHE22Q8NFJ8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BHLHE22Q8NFJ8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BHLHE22Q8NFJ8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BHLHE22Q8NFJ8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BHLHE22Q8NFJ8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BHLHE22Q8NFJ8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BHLHE22Q8NFJ8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BHLHE22Q8NFJ8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BHLHE22Q8NFJ8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BHLHE22Q8NFJ8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BHLHE22Q8NFJ8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BHLHE22Q8NFJ8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BHLHE22Q8NFJ8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BHLHE22Q8NFJ8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BHLHE22Q8NFJ8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BHLHE22Q8NFJ8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BHLHE22Q8NFJ8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BHLHE22Q8NFJ8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BHLHE22Q8NFJ8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BHLHE22Q8NFJ8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BHLHE22Q8NFJ8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BHLHE22Q8NFJ8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BHLHE22Q8NFJ8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BHLHE22Q8NFJ8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BHLHE22Q8NFJ8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BHLHE22Q8NFJ8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BHLHE22Q8NFJ8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BHLHE22Q8NFJ8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BHLHE22Q8NFJ8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BHLHE22Q8NFJ8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BHLHE22Q8NFJ8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BHLHE22Q8NFJ8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BHLHE22Q8NFJ8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms